通常对于囊肿的治疗来说，首先要彻底分清区分囊肿是属于良性还是恶性的。如果囊肿是良性的，没有必要担心了，可以通过口服一些中药进行保守治疗慢慢调养。但如果囊肿是恶性的话建议要尽早采用手术的治疗方式进行治疗，如果手术治疗方式效果不佳的话，还可以再生全身化疗的方式，这些方法就可以彻底治疗囊肿。如肾脏囊肿，若是4cm以上的肾脏囊肿，可以通过腹腔镜手术就可以治疗；4cm以下的肾脏囊肿，也可以通过B超定位下穿刺进行治疗。
一般来说，附件囊肿破了，但是在破裂的时候出血量不大，没有出现明显的休克，或者是没有同房的情况下，可以采取保守的方法来进行止血。如果是附件的巧克力囊肿，一旦破了，下腹的痛苦就会加重，出现脸色苍白、心慌等休克的情况，就必须马上进行开腹，在这个时候，不仅要将囊肿全部取出，然后进行包扎，然后再用生理盐水清洗。术后的六个月，为了防止再次出现的朱古力囊肿，需要肌肉注射曲。
此外，应该保持良好的心态，同时注意休息，保证饮食营养的均衡摄入，有助于症状恢复。
通常来说，妊娠期间出现宫颈囊肿的处理方式，要考虑到囊肿的体积，具体分析如下：
宫颈囊肿多为主良性，如果囊肿不大，没有阴道流血、腹部疼痛等症状，定时进行检查。但如果囊肿很大，并且已经挤压到了肚子，最好做一个针刺，在生产完后进一步做手术。
怀孕期间，孕妇要注意保持愉悦的心情，以清淡、易消化的饮食为主，不要进行重体力劳动，定期进行产前检查，以免胎儿发育受到影响。
阴道囊肿主要形成于阴道的前壁，而对于女性来说，通常需要结合阴道镜检查和病理活检来确定是否为阴道囊肿。
阴道囊肿体积增大，可能会引起患者在性交时感到疼痛或遇到困难，并且当囊肿扩大到某个程度时，可能会破裂，这进一步可能导致某些部位的分泌物显著增多。
在临床实践中，对于阴道囊肿，应当及时进行手术干预，确保阴道囊肿被彻底清除，防止对正常的性生活产生不良影响。阴道囊肿如果持续扩大，可能会引起阴道的形态异常，这不仅会干扰正常的性活动，还可能增加未来受孕的难度。
因此，在临床实践中，患者必须严格关注性生活的卫生状况，以减少性活动的过度频率。在宫颈炎或阴道炎的情况下，应当采取积极的药物治疗手段。
宫颈囊肿是不需要处理的，因为宫颈囊肿是慢性炎症刺激宫颈，柱状上皮重新生长的过程中，堵塞腺体的开口，导致分泌物排不出去，阻塞在腺体里面引起的囊肿，是慢性宫颈炎的一种类型，所以不需要处理，定期观察就可以了。如果有多发的宫颈囊肿，可以去做阴道镜，在阴道镜下进行病理活检，如果没有合并上皮内瘤变等情况，是不需要处理的，观察就可以了。
卵巢囊肿手术治疗的方法，由自身综合情况来选择的。如果，年龄比较大，没有生育要求了，可以选择同时切除卵巢，这是指卵巢上是良性的肿瘤，如果卵巢上的肿瘤是恶性的，那就是必须要切除卵巢了。
