口腔溃疡的治疗以消除病因、增强体质、对症治疗为主，治疗方法应坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合。口腔溃疡常呈周期性发作，复发时间长短与口腔溃疡病史长短有密切关系。
口腔溃疡多般是由于上火、炎症、感染和免疫力低下以及缺乏维生素等原因造成的。对于其初期的治疗可以用口含片或者是喷剂进行治疗，另外要注意口腔卫生和饮食清淡，此外还可以适当补充b族维生素并多喝水。
孕期口腔溃疡需要通过局部治疗、日常护理等方式来治疗。
怀孕期间有口腔溃疡需要进行局部的治疗，同时需要在口腔科或者妇科专家的帮助下进行局部的用药，避免自行服用，导致自身和胎儿都出现异常。可以用生理盐水，不会造成任何的伤害，可以用来漱口，可以购买0.9%的生理盐水涂抹在口腔的创面，也可以用95%的乙醇来治疗，不过要在医师的指导下进行。
常用的药物有药膜，可以外用减轻症状，以及中药的一些散剂，口服维生素C和复合维生素B等药物，平常注意休息，避免进食酸辣刺激食物，以减少复发次数，腔溃疡大多为复发性口腔溃疡，因为局部疼痛，影响饮食，语言等会给生活带来很大的困扰，所以有口腔溃疡后应该及时治疗，减轻症状。
儿童口腔溃疡是由细菌感染引起的，需要给予抗感染治疗。在抗感染治疗之前，可以完善血常规、C反应蛋白、血培养等检查指导用药。注意多饮用温水，绿色食品，少食用油腻辣的食品。
