肾小球肾炎的治疗要针对免疫发病机制的治疗，常包括糖皮质激素及免疫抑制剂治疗。血液净化治疗如血浆置换、免疫吸附等有效清除体内自身抗体和抗原抗体复合物。针对非免疫发病机制的治疗，包括高血压、高血脂、高血糖、高尿酸血症、肥胖、蛋白尿及肾内高凝状态、肾素血管紧张素系统激活、氧化应激等治疗。
中医治疗慢性肾炎主要是从肺脾肾三脏着手，一般是宣肺健脾，补肾，利尿，病久还可以配以活血化瘀的药物，比如三七粉可以使尿中蛋白消失，慢性肾炎晚期往往是顽固性的蛋白尿，很难消退，治疗慢性肾炎是以益气健脾，活血化瘀为主。
有些肾炎中医是能够治好的，比如隐匿性肾炎，这样的轻型肾炎，中医是有优势的。但是，作为慢性的肾小球肾炎以及肾病综合征，可以用中医、中药的方式缓解症状，但不能治好这种疾病。
轻微肾炎可以治疗，且预后良好。轻度肾炎主要是药物治疗，同时要卧床静养，保证充足的睡眠，药物方面要对症用药，若出现水肿和蛋白尿，可用糖皮质激素和血管紧张素转换酶抑制剂治疗。
中医治疗肾炎可以进行一些中药来进行治疗，然后平时要多注意休息。肾炎的中医治法很多，比如针灸、中药、外敷、灌肠、食疗等。具体来说，中医认为肾炎大致上就是以水肿和血尿为辨证基础，通过扶正驱邪的方式进行治疗。应用的方法主要以中药为主，应用各种汤剂，对肾炎的部分症状能够起到明显的缓解作用。
