治疗病毒疣，首先应根据病毒疣生长在哪里，疣体有多大，有多大等情况，制订治疗方案。
通常可外用氟尿嘧啶软膏治疗、咪喹莫特膏、干扰素软膏，酞丁胺擦剂治疗，如有需要，也可将疣体刮除，再用碘伏、医用酒精消毒，能够有效的改善病症，在治疗期间要注意多休息，有助于病情恢复。
通常病毒疣可以根治。
就寻常疣而言，可以用冰冻、雷射、电离子来进行。出现大范围的皮肤炎症时，可以给予免疫调节剂，例如：干扰素、卡介菌多糖核酸注射液等，还可以服用转移因子胶囊。还有就是传染性软疣，通常只要进行有效的刮疣就可以了，一般可达到较好的治疗效果。
病毒疣相当部分可根治，患者不必过多担忧，积极治疗即可。
病毒疣所含病种较多，多见扁平疣，寻常疣，丝状疣和尖锐湿疣，尖锐湿疣为性传播疾病。需接受正规处理，可以根治，还要更加注意个人卫生和保持局部清洁、干燥。饮食方面尽量不食辛辣刺激的食物，对人体康复有好处。
病毒疣一般指疣，一般是通过外用药物和物理疗法来进行治疗。
外用药一般是针对大面积的皮疹或者是难以进行物理治疗的，具体的用药和方法也会有所不同。维A酸软膏主要用于治疗扁平疣，对顽固性跖疣，平阳霉素、5-氟尿嘧啶注射液均能引起疣体萎缩、脱落。对于皮疹数量较小的患者，一般采用冷冻、电灼、刮除、激光等物理治疗。
其实病毒疣是无法根治的。
病毒疣的种类很多，除了需要用镊子夹住传染性软疣之外，其他的病毒疣都可以通过冷冻、激光、微波、电离子治疗仪进行治疗，如果一次不够，还可以多次治疗。激光去除丝状疣和扁平疣的效果最好。
病毒疣可以通过口服和外用中药熏洗浸泡来治疗。皮肤表面疣具有传染性，主要是通过自身接种或者共用毛巾、浴巾等方式传播。尖锐湿疣主要是通过性传播的。