男性人乳头瘤病毒可以进行药物治疗、手术治疗以及物理治疗。
感染人乳头瘤病毒后，可以采用利普刀切除，冷冻治疗，微波治疗。药物治疗一般是在局部涂抹。最普通的有米奎莫特。还可以使用抗hpv生物蛋白的辅料。也可以使用诸如白介素、干扰素等免疫抑制剂。
干扰素、胸腺五肽、转移因子等都是目前治疗人乳头瘤病毒的主要药物。
人乳头瘤病毒可以引起细胞免疫，使其产生更多的细胞因子，从而将人体中的HPV清除。人乳头瘤病毒能感染皮肤，导致多种疣样皮肤病。人乳头瘤病毒的主要宿主是人类表皮细胞，可以透过皮肤的损伤，进入表皮，在表皮细胞中繁殖。
人乳头瘤病毒的感染是可以通过药物来治疗的。
如果病人感染了HPV，可以在医生的指导下应用他克莫司软膏或者咪喹莫特软膏，以减轻病人的痛苦。还可以通过使用转移因子等药物来增强身体的免疫力，从而达到恢复的目的。对于严重的人乳头瘤病毒，可以通过外科手术切除。
药物治疗。由于高危人乳头瘤主要发生在女性身上，因此感染了66型病毒以后，如果病毒含量不高，女性可以尝试采取药物治疗。激光治疗。激光也是除了药物之外，对于人乳头瘤病毒应用的比较广泛的治疗方法。因为激光渗透杀菌的能力强，尤其是以光动力为主的升级版激光治疗方式，比起一般激光治疗效果更好。
这样来看，目前主要是人乳头瘤病毒感染的问题，这是机体抵抗力低下所导致的病毒感染。建议患者需要注意休息，增强机体的抵抗力，同时明确诊断以后可以积极的使用说的这些抗病毒药物治疗，并且还需要注意复查。
妊娠期尖锐湿疣的治疗妊娠妇女因体内激素水平的变化，免疫功能低下，胎儿重力压迫，致外阴充血，分泌物增多，潮湿，更适宜于HPV繁殖，故妊娠期尖锐湿疣应及早治疗，多以局部物理治疗或三氯醋酸外涂，避免使用细胞毒性药物，对有较大的尖锐湿疣病人应规劝其终止妊娠，避免胎儿经产道感染，分娩应采取剖宫产术。
