传染性软疣一直不治疗可能会越来越严重，还可能造成传染。
传染性软疣不治疗，可能会导致体积增大、影响美观，同时还可能会交叉感染。
患者需要积极就医检查治疗，这种疾病有一定的传染性，如果治疗不及时可能会导致传染性软疣传染给其他人，特别是性伴侣，患者可以在医生指导下使用抗病毒类药物治疗，避免情况加重。
治疗方法是用小血管钳夹住疣体后挤出白色内容物，然后压迫止血或者用冷冻疗法或激光疗法去除疣体；平时要注意卫生，勤剪指甲，避免搔抓皮肤，不去公共浴池洗澡或游泳，不与他人共用毛巾、衣物等。
在治疗的时候主要是采用物理治疗，比如局部的刮除或者用液态氮冷冻，人工挤压等。临床上最常用的就是在无菌条件下，用有齿镊或者止血钳将软疣夹破，把里边的软疣小体挤出来，然后外用碘酊消毒预防细菌感染。
首先如果是数量比较少，患者的抵抗力比较强的话，可以观察，可能在数月之后皮疹会消退。这样的患者是不需要治疗的。但是大部分人或者说是患儿来说，不治疗在数月之后会逐渐增加甚至增大，伴有瘙痒的特点，像这种有逐渐增多倾向的患者，还是需要及早进行治疗，以防传染给他人或者因自身接种而使病情加重。
严重影响了生育问题。传染婴儿、影响生育质量。患生殖道疣的孕妇，在分娩时，通过产道的婴儿可能被传染，引起婴幼儿的呼吸道疣。本病如不及时治疗，可危害个人、危害家庭、危害后代、危害社会。传染性软疣是可传染给家人的。传染性软疣不但能通过性接触传播，而且其家人或朋友，能通过污染了病毒的浴巾、浴盆、内裤等间接接触传染。
传染性软疣是可根治的。
传染性软疣的治疗方法有手术，激光，冷冻，电灼等、药物和其他途径可根治，提示患者应根据实际情况选择特定治疗方案。部分患者甚至可以自愈，通常在半年至九个月后可自行消退，还有坚持3~4年的。它是由自身抗体的生成来决定的，和自身抗体出现的迟早，抗体生成越早，皮损消退越早。