人乳头瘤病毒的治疗方式主要有物理治疗以及药物治疗等。
1、物理治疗：有电灼，利普刀切除术、冷冻治疗、微波治疗等。
2、药物治疗：常用的药物为咪喹莫特乳膏治疗，适用于局部肿瘤的消除和局部病灶的清除。此外还可以使用免疫抑制剂，通过白介素类药物，增强病人的自身免疫功能，排除阳性体征。
物理治疗：包括电灼、利普刀切除术、冷冻治疗、微波治疗等。可应用抗HPV生物蛋白敷料，其转阴率较高；还可应用免疫抑制剂，通过白介素类药物，提高患者自身免疫功能，消除阳性体征。
人乳头瘤病毒感染根据分型，治疗方式存在差异。
例如人乳头瘤病毒感染低危型，在不引起宫颈病变的情况下，病毒可由本身抵抗力清除。人乳头瘤病毒并不引起宫颈病变，属慢性宫颈炎之类可应用促病毒消失药物，如干扰素、生物蛋白敷料，及保妇康栓之类的药物，以有助于人乳头瘤病毒的去除。高危的情况下，可能需要手术进行治疗。
发现不适就及时去医院接受检查，对症下药。要时刻保持好的习惯，不让疾病对我们的身体进行肆意伤害。尖锐湿疣一般发生于私密部位，患处有赘生物，有恶臭味，而且，有暗红色的丘疹，乳头样突起。尖锐湿疣是有HVP病毒传染所致。
一般是用塞入阴道进行治疗的。感染的是高危型，如果长期带毒，可能以后引起宫颈癌的。当然不治疗依靠自身免疫有60%的人会自愈的，人乳头瘤病毒56型阳性指高危HPV感染，注意个人卫生，保持外阴清洁，干燥，勤换内裤，外阴用具专人专用，定期复查。
人乳头瘤病毒感染通常不好治疗。
人乳头瘤病毒感染传染性较强，主要通过性接触传播。人乳头瘤病毒感染患者常会诱发尖锐湿疣、寻常疣等疾病，还可能会有癌变的风险，患者可能会患上宫颈癌。由于人乳头瘤病毒感染通常容易复发，因此治疗起来比较困难，建议患者尽量配合医生进行治疗，以控制病情的进展。