甲状腺功能减退的治疗方法主要采用合成的甲状腺激素，即左甲状腺激素片替代治疗。
口服左甲状腺激素片可以恢复足够的激素水平，逆转甲状腺功能减退的症状和生命体征。左甲状腺激素片治疗可能终身，主要取决于甲状腺功能减退的原因。左甲状腺激素片的剂量需根据甲状腺功能复检结果进行调整，对于甲减患者，如果服用可能引起甲减或加重甲减的药物，需咨询医生，测定利弊后决定是否中止。另外，在碘不足的地区，为了纠正碘不足，需要给与足量的碘剂。左甲状腺激素片在适量使用时几乎没有副作用。
甲状腺功能低下是由甲状腺激素分泌不足引起的。用纯中药和中西医结合治疗甲状腺炎、甲状腺功能减退、甲状腺功能减退等甲状腺疾病是一种理想的方法，能彻底治愈甲状腺炎、甲状腺功能减退、甲状腺功能减退等甲状腺疾病。
甲状腺功能低下可以使用药物性甲减治疗，常见甲减的原因是桥本甲状腺炎，碘131治疗或手术后出现的并发症，需要根据甲功结果给予药物治疗，每3-4周复查一次甲功，直至甲功恢复到正常，三个月到半年复查一次甲功。而对于继发性甲减，需要找到病因。
一般情况下，甲状腺功能低下能否治愈需要根据病因进行判断，具体内容如下：
1.能治愈：单纯缺碘可能会造成患者甲状腺合成甲状腺素较少，导致患者甲状腺功能低下，此时，甲状腺功能低下是能治愈的，患者可以通过适量多吃含碘的食物来促进甲状腺功能恢复正常。
2.不能治愈：甲状腺手术、放射性碘治疗等可能会对伤甲状腺组织造成损害，导致患者甲状腺功能低下，此时，甲状腺功能低下通常不能治愈，患者需要终身服药，以控制病情，缓解症状。
新生儿出生后一般都需要在出生三天左右进行足跟血的采集，就是甲状腺功能低下的筛查。因为甲状腺功能低下有可能会对孩子的智力发育，体格的增长产生非常大的影响。
很多孩子进行检查，会发现有甲状腺功能低下症状，或者有促甲状腺激素水平升高或者偏低的情况。如果出现有数值的异常，考虑进行复查。很多孩子在进行复查以后都会有明显的改善，而且很多孩子是可以达到正常范围的。一般并不需要特别的治疗。如果复查之后仍然存在甲状腺功能异常，可以考虑应用相关的药物进行治疗。
有76%的人会有抑郁的表现，比如无助，往往先于身体的表现。
有些病人还会出现幻觉，幻想等心理疾病。在做完手术之后，还可能会导致患有抑郁症，如甲状腺炎、长期服用锂盐等。与此形成对照的是，约10%的忧郁症病人存在某种程度的低甲状腺激素，并且经常出现亚临床症状。无征兆的自体免疫性甲状腺炎，在接受锂盐疗法的病人和分娩病人中，都会出现轻度的甲减，这些都会使病人出现忧郁症。