多囊卵巢是会影响怀孕的，多囊卵巢是由于雄激素过高，从而导致的卵泡发育不良，确定是多囊卵巢，可以用促进排卵的药物，还可以用雌激素和孕激素建立人工周期的促进排卵受孕的。
轻微的多囊卵巢或者偶尔排卵的情况下有了性生活，是能够自然怀孕的。多囊卵巢是女性常见的妇科内分泌疾病，其中一个很重要的影响会引起排卵障碍，所以多囊卵巢是常见的引起不孕的因素。但是并不意味着多囊卵巢无法自然怀孕，多囊卵巢只是提示女性受孕的概率比较低。多囊卵巢自然怀孕一定要与多囊卵巢所引起的月经推迟相鉴别，避免造成怀孕的漏诊。多囊卵巢怀孕以后一定要注意早期观察，定期孕检，观察胎儿的生长发育情况，避免发生早孕流产。
多囊卵巢胎停的风险要高于正常情况下的胎儿。
这与胰岛素抵抗、高雄、内分泌失调等因素密切相关。这种情况下，孕妇要做好长时间的监护，最起码要监测3个多月，看看是否存在胎儿停止的危险。下腹部有轻微的疼痛或是有轻微的流血现象，需要及时到专业的医院进行全面的检查，由医生进行保胎。由于存在着胎儿停止的风险，所以多囊卵巢的发病率要高于普通人，出现2-3次以上的多囊卵巢导致的胎停育，要及时到正规的医院进行调理，由于卵子的生长周期一般是3个月，最好是怀孕前2-3个月，之后才能怀孕，这样孩子会比较好，出现胎停的可能性也会小一些。
多囊卵巢怀孕以后不一定会发生胚胎停育的情况，胚胎停育也可能是其它原因所引起的。多囊卵巢一般会有卵泡发育异常以及不排卵的情况，如果怀孕了，一般可以正常妊娠，发生胚胎停育的情况并不多的。有多囊卵巢还需要用药进行治疗。
经过治疗以后还是可以怀孕的。多囊卵巢综合征是一种以持续性不排卵为特征的内分泌紊乱性疾病。多囊卵巢综合症可以吃药进行调理。月经来潮第5天开始吃药连服，21天为一个疗程。需要连续调理至少3~6个月，对于多囊卵巢综合症也能起到一定的辅助治疗作用。
多囊卵巢自然怀孕的几率是相当低的，因为体内的雄激素往往会高于一般水平，所以往往会出现排卵异常的情况，需要进行治疗才能够完成受孕，至于这种，需要去正规的医院进行检查才能够明确结果。