巧克力囊肿怀孕初期是会腹痛。巧克力囊肿又名卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种。一般子宫内膜生长在子宫内，但是在月经期的时候由于子宫内膜的脱落，经血可能逆流，比如在经期发生性行为，可能会导致经血逆流到输卵管进入盆腔，进而种植在卵巢表面或者是盆腔其他部位，形成异位囊肿。
卵巢囊肿会引起腹痛的，应该去医院彩超检查囊肿的变化，如果卵巢囊肿比较大了，还是手术治疗比较好的，卵巢囊肿手术恢复挺好的。术后一定要注意休息，不要吃生冷硬的食物，不要着凉。
如果是在怀孕20多日内发生腹部疼痛，那么有可能是由于下列因素引起的：
1.流产后身体抵抗力下降，免疫力下降，不注重个人清洁，过早同房，会导致流产后的炎症，引起腹部疼痛。
2.人流后要注意清淡、营养、易消化的食物，避免食用辛辣刺激、冰冷、寒凉的食品。
建议女性如果腹痛明显，应该到医院就诊，查找原因后对症处理。
卵巢囊肿做完手术之后，出现腹痛考虑手术后恢复的问题，有可能是周围出现了盆腔组织的粘连，出现一个暂时性的疼痛，可以采取红外线理疗或者是，适当的走动按摩都可以，如还是不好可以去医院复查一下，看看具体是怎么回事。
要区分出是手术刀口疼痛，还是腹部疼痛，以及术后多久会出现腹部疼痛。具体内容如下：
在做完手术之后72个小时之内出现伤口疼痛是很常见的，如果持续时间长达72个小时还会出现伤口疼痛，就要考虑是不是有伤口感染。肠管通气后，若出现腹胀或腹部疼痛，应警惕是否有腹腔感染或肠粘连。
手术当日禁食，术后1～2日胃肠蠕动恢复、肛门排气后可进流食，逐渐过渡到普食，期间可适当给予静脉营养支持。
如果患者的卵巢囊肿比较小，一般是不会引起腹痛、腹胀等现象的。但如果患者的卵巢囊肿比较大，或是多发的，就容易对子宫内的组织产生压迫，从而引发腹痛、腹胀等症状。
当患者不确定时，建议患者要及时到医院进行检查，明确患者的具体情况，然后根据患者的情况进行治疗。如果病情不严重，可以暂时观察，不必担心，但如果卵巢囊肿有恶化倾向，则要及时手术，将病灶切除。
