肾结石可以通过体格检查和影像学检查确诊。尿液常规检查，观察是否有尿糖、尿蛋白、红细胞、白细胞等，判断是否合并尿路感染及糖尿病等；血常规检查，如白细胞的数目增多，则可能存在感染。
肾结石的检查大多数是依赖于影像学的检查如X线检查，X线检查是诊断尿路结石最重要的方法包括尿路平片、排泄性尿路造影、逆行肾盂造影、经皮肾穿刺造影等。可能是B超检查，可对肾内和无结石及有无其他合并病变作出诊断，确定有无肾脏积水，尤其能发现X线透光的结石，还能对结石造成的肾损害和某些结石的病因提供一定的证据。CT检查是目前结石诊断的首选。
通常来说，诊断胆结石需要做腹部CT检查、B超检查、核磁共振检查等检查。
胆结石包括胆囊和胆管的任何部位发生结石的疾病。按发生的部位来分，可分为胆囊结石、肝外胆管结石和肝内胆管结石或者上述多部位同时并发，其中胆囊结石占全部结石的50%左右。胆石病的临床表现以右上腹胆性绞痛、黄疸和发热为三大主证，其疼痛往往于夜间、饱餐后或进食高脂肪食物后发作，疼痛可向右肩或右肩胛部放射。通常可以进行腹部CT检查、B超检查、核磁共振检查等检查。
肾结石可以通过体格检查和影像学检查确诊。体格检查即肋腰点在第12肋下缘与腰大肌外缘叩痛明显，提示可能存在肾结石。确诊是通过泌尿系彩超、腹部立位平片或者泌尿系CT检查来确诊。
一般来说，胆囊结石的检查包括以下几种：
1、多普勒彩超：胆囊内结石能清晰的显示出来，结石的发现率高，而且是无创性的，费用低，是临床上首选的检查方法。
2、CT或MR：若不能确定是否是慢性胆囊炎或急性胆囊炎，应做CT或MR，但CT或MR检查比较昂贵，不能作为常规的检查。
3、X光：胆囊结石中有一些是胆固醇性结石，X光不能显影，不易发现，因此在临床上很难找到。