遗传因素为最主要的因素，与胚胎染色体异常有关。父母的年龄较大为胎儿停育的主要危险因素之一。孕妇子宫畸形、盆腔感染、患免疫相关疾病，也是主要的危险因素之一，既往自然流产史、不孕及辅助生殖、孕期药物使用、孕期吸烟，经常饮用含有咖啡因或酒精类饮料、肥胖、甲状腺功能不全等也是危险因素，可引起胎儿停育的发生。
胚胎停止发育的病因，包括胚胎因素、母体因素、父亲因素和环境因素，胚胎因素是胚胎或者胎儿的染色体异常所致。母亲的因素包括孕妇患全身性疾病，比如严重的感染，高热，或者生殖器官发育异常，比如子宫畸形，内分泌异常，强烈的应激与不良习惯。父亲的因素主要是精子的染色体异常，环境因素包括过多接触放射线或者重金属等化学物质。
胚胎停育是因为一些生活的恶习而引起的，不改掉这些恶习，就算治疗以后，还是会复发的。胚胎停育是因为一些生活的恶习而引起的，不改掉这些恶习，胎停育一般是发生在孕早期，受精卵的质量不好就会出现停止继续生长。
胎儿停育，胚胎自身原因的占比是最高的，高达50%。正常胚胎应该有23对染色体，但是一旦数量或者结构出现异常，胚胎发育都会停止。其次是孕妇身体原因，如孕妇的子宫畸形、子宫疾病、子宫受到病毒和细菌感染，都有可能导致胎儿停止发育或者流产。
胎停育一般是因为染色体异常引起的，也可能是母体子宫有畸形或是因为夫妻之间年纪比较大怀孕的。在怀孕之前或者怀孕初期有接触化学物质，放射线，有毒的物质等。怀孕期间少吃辛辣油腻生冷刺激的食物，注意性生活卫生，注意个人卫生，勤换内裤，纯棉质地，开水烫洗，太阳暴晒。