口腔囊肿也是分好多情况，而如果囊肿是牙源性来源的囊肿，是体积比较小，范围比较局限在根尖的附近。经过根管治疗以后，有一部分囊肿是可以自己消失的，是不需要做手术治疗。如果囊肿的体积比较大，或者非牙源形性的，有一些囊肿甚至是x线检查觉得像是囊肿，其实是肿瘤，比如角化囊性瘤，就是以前称为角化囊肿，造釉细胞瘤等之类的肿瘤，就是不会自己消失的，需要尽快做手术。
口腔黏液性囊肿一般是没什么事情的，平时可以注意下消炎治疗，吃些消炎药物就可以了，如果病情严重，可以做手术治疗，手术后是可以恢复的，平时注意下饮食，不要吃辛辣上火的东西。
口腔颌面部囊肿是一种常见的、多发病类型，其中以软组织囊肿、硬组织囊肿为主，例如颌骨囊肿。
皮样表皮囊肿、皮脂腺囊肿是囊肿的一种类型，其临床表现为皮脂腺囊肿的发病部位皮肤稍膨隆、肿胀，继发性感染可出现皮肤红肿、发热、疼痛、体温上升等。一些囊肿没有明显的表现，一般要通过影像检查才能确诊。
此外，在大唾液腺中还可以发现囊肿。粘液囊肿是一种黏液囊肿，其表现为透明状的小泡，破溃后会有蛋清样黏液、拉丝状液体等。
口腔囊肿分为发育性和炎性囊肿，发育性囊肿是指在牙胚牙齿的发育过程中或颌骨的发育过程中形成了囊肿，炎性囊肿是指口腔炎症所继发的囊肿，通常见于根尖炎，牙周炎或者其他疾病继发出现，需要到医院的口腔科就诊检查。此类疾病需要做到早期发现，早期治疗，平时可能需要加强预防，尤其注意口腔的卫生。
口腔囊肿一般分为根尖周囊肿，含牙囊肿，以及牙源性角化囊肿。范围小的根尖周囊肿，可以在牙齿做完根管治疗后，进行囊肿的搔刮术，把囊肿清理出来。含牙囊肿的治疗原则是，手术摘除囊肿以及囊肿内所含的牙齿。