夜间酵素副作用是过敏反应，少部分人进食后，会引起皮疹、瘙痒、出汗、腹痛等不良反应，因此对酵素过敏者应该禁用。糖尿病病人应该慎用。容易引起胃部不舒适的感觉，酵素属于弱酸性的物质。
酵素是不可以长期吃的，酵素对于肠胃的伤害是非常大的，如果长期的服用酵素除了对肠胃的伤害很大以外，还会对身体的其他器官造成一定的伤害，而且减肥是要通过饮食，和运动才能够达到健康减肥的目的，如果通过减肥药或者是减肥的食物，是不能够达到减肥的目的，还会对身体造成伤害。
酵素的功效是促进人体的代谢，可以改善人体的消化，使营养物质能更好的被人体所吸收，能够增强人体的免疫力。主要是辅助治疗消化系统的疾病，比如便秘、胃炎，也可以改善人体的血脂情况，使血脂下降，使血液循环得到改善，减少血栓的形成，而且可以促进新陈代谢，减少疼痛，预防和治疗炎症的感染。
酵素含有大量的益生菌，维生素和多种营养物质，适量的服用有利于身体的健康，可以缓解精神压力过大而引起的失眠，有促进消化调理肠道功能。在用酵素调理身体时，宜饭后服用，减少胃肠道的刺激症状，还可以增加药物的吸收。在服用酵素时应禁吃甜食，甜食可以分解酵素而使酵素失去作用。服用酵素时注意温度不要太高，温度过高时酵素失去作用。
不会产生副作用，可以长期服用，有助于重病或疑难杂症的恢复。但是人体个别的差异性非常大，有些人对综合酵素也会过敏，只是反应程度与频率均很轻微。但这些症状并非由酵素副作用引起，简而言之，就是说酵素作为一种对身体很好的营养品，是没有任何副作用的。
酵素治糖尿病配方如下所示：
第一、酵素更适合糖尿病人。还有一种方法叫糖尿病酶疗法，可能在一定程度上帮助胰岛细胞分泌胰岛素。这种通过饮食来改善是比较好的方法，更容易被大众接受。但是在治疗的过程中需要有耐心，因为这种酵素疗法的方法需要很长时间才能见效。如果半途而废，就不能有效治疗。
第二、其次，临床上也会为患者提供一些酵素的配方。糖尿病患者一定要选择适合糖尿病人制酶的食物，选择含糖量低的蔬菜和水果，包括：苦瓜、南瓜、黄瓜、丝瓜、葫芦、玉米粒、鲜毛豆、鲜花、木瓜、柠檬、番茄、秋葵、苹果、大蒜、青椒、冬瓜、樱桃。
