脂肪肝引起肝功能异常可以通过以下几种方式治疗：
1.一般治疗:限制机体热量摄入,以控制体重,对饮食结构进行调整,少吃高脂、油炸的食物,多吃粗粮、蔬菜等。
2.药物治疗:可在医生指导下使用复方甘草酸苷片、还原型谷胱甘肽等药物进行保肝治疗。
3.手术治疗:如果脂肪肝患者肝功能异常,使用以上药物治疗无效,病情持续发展,导致肝硬化、肝脏衰竭,可考虑通过肝脏移植手术进行治疗。
患者需要注意的是，营养不良引起的要注意加强营养。过度节食引起的停止节食注意均衡营养。糖尿病引起的要控制血糖等。
甲状腺功能亢进一般不会直接影响肝功能，反而一直服用抗甲状腺的药物对肝功能有影响。一般药物都有毒性。但是治疗甲状腺功能亢进的药可能对肝脏的损害会大一些。
乙肝合并肝功能异常治疗可以进行保肝治疗和抗病毒治疗。肝功能异常的保肝方法有口服保肝药物疗法和静脉滴注保肝药物疗法。肝功能轻度发生异常时，可以应用口服的保肝药物，肝功能中度或者重度异常时，需要静脉滴注保肝药物。
一定要及时作全面的检查，查明具体的病因，针对不同的表现和病因采用不同的治疗方法，比如：保肝，降黄，抗病毒，降脂等对症治疗，标本兼治。如果是乙肝、肝硬化、脂肪肝等疾病因素引起的肝功能异常，要及时对症治疗。如果是饮酒、过度劳累、熬夜、肥胖、服用药物等因素导致的肝功能异常，要及时进行调理，注意休息和合理的饮食，有望恢复正常。
怀孕期间若肝功能轻度异常，可能与妊娠期生理反应、肝脏负担加重、休息不足、身体劳累等因素有关。而肝功能严重异常则可能是患有肝硬化、病毒性肝炎、胆汁淤积症引起的肝损伤。
因此，需要根据肝功能异常的轻重程度，及导致肝功能异常的具体原因，采取不同的措施。若怀孕期间肝功能轻度异常，可做注意休息，避免劳累，若孕期转氨酶升高没有超过正常值两倍以上，通常不需要特殊的处理。如肝功能严重异常，转氨酶显著升高，则需要在医生的指导下进行保肝降酶的治疗，合理用药，避免影响胎儿健康发育。
