进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
男性检查hpv可以进行体格检查、醋酸白试验等检查。
男性感染了HPV后，阴茎体、龟头等部位可能会有小红疹，可以及时前往正规医院，由专业医生进行体格检查，判断有无明显的症状。另外，患者还可以配合医生进行醋酸白试验，如果局部皮肤黏膜出现白色的情况，则说明存在HPV感染。
月经推迟或提前一周都属于正常现象。如果不放心可以做早孕试纸测定或在停经42天左右做B超检查以明确是否宫内怀孕。如果想怀孕应该在排卵期同房，受孕的几率更大，排卵日是在月经前14天左右，排卵日的前5天和后4天属于排卵期。
胃镜检查时，医生右手持镜前段将胃镜放入舌根部，此时病人进行吞咽动作，将胃镜送入食道，而后继续向下送镜子观察胃及十二指肠情况。肠镜是利用一条装有微型摄影机的纤维软管进行检查，其由肛门进入肠道，顺势观察肠腔情况。
肛瘘的检查方法可以做肛门指检，肛门指检为最常见、最直接的检查方法，可触及条索状物及硬结。还有就是美兰造影，将美兰从外口打进，如果美兰由肛门流出，可诊断肛瘘。影像学检查包括B超、磁共振、肛瘘造影。手术探查需在麻醉状态下进行。
