在药物治疗上，要根据尿液培养和药敏试验选用敏感抗生素进行治疗。附睾炎多为细菌感染所致，常继发于泌尿系感染，致病菌多数是大肠杆菌和绿脓杆菌。需要到医院做进一步的检查，才能明确病因，在医生的指导下合理治疗。
只要确定附睾炎，如果急性的，首选抗生素，输液1-2周之后再继续用2-4周。如果急性期没有得到良好控制，转化成慢性的，中医辨证服用中草药效果可能要更好一点。初期红肿、热痛时候用中药外敷或者用其他的冷敷效果也是可以的。
附睾炎的治疗分为急性附睾炎和慢性附睾炎，附睾炎是泌尿外科常见疾病，出现附睾炎的症状之后细菌经尿道逆行感染导致，致病菌多为球菌、杆菌以及厌氧菌，大多数情况下是混合性感染，可以应用相应的抗生素进行治疗。
一般情况下，附睾炎患者通常可以吃诺氟沙星。具体分析如下：
如果感染了支原体、衣原体以及大肠杆菌等，就会导致附睾炎的发生。诺氟沙星是一种对上述细菌具有很好的治疗作用的喹诺酮类药物。诺氟沙星是一种比较低级的喹诺酮类抗生素，其抗菌效果比较差，不适合治疗重度的附睾炎。还有一点要注意，18岁之前的患者不要使用诺氟沙星，否则会对身体造成不良的影响。
如果是细菌感染导致的龟头炎，可以服用此药物治疗，另外可以配合其他消炎药治疗。如果病情严重应该及时就诊检查，依据病情采取清创消毒治疗，然后再选择消炎药治疗。