囊肿比较小，而且没有出现异常的症状，可以采取药物治疗，但是药物治疗的效果比较差，所以要进行定期的检查。如果囊肿已经出现了压迫周围组织或者是器官的，要采取紧急手术治疗。
患有尿道口囊肿与机体免疫力低下和内分泌失调直接相关，可导致免疫力下降和局部尿道口扩张，从而引起感染。在正常饮食中，患者应该多吃蔬菜、苹果、香蕉、葡萄、西红柿、绿豆芽、胡萝卜，少吃油腻、油炸、腌制和烟熏的食物。膀胱切除术通常被用来治疗这种疾病。
尿道口囊肿是先天性病变被认为是由包皮从龟头上分离出现障碍或者尿道口旁的导管闭塞而引起。后天性囊肿可能由感染引起。简单的囊肿穿刺抽液或者去顶术可能导致复发。
尿道口囊肿是输尿管末端的囊性扩张，胚胎发育期输尿管与尿生殖窦之间的隔膜未吸收消退，形成输尿管口不同程度的狭窄，也可是输尿管末端纤维结构薄弱或壁间段的行径过长，过弯等因素引起，经尿流冲击后形成囊性扩张突入膀胱。
脑囊肿可分为蛛网膜囊肿和室管膜囊肿，前者占绝大多数，后者少见。蛛网膜囊肿是脑脊液样的囊液被包围在蛛网膜所形成的袋状结构而成，最常见于中颅底、桥小脑角、鞍上和颅后窝等。可致颅内高压，引起脑水肿、脑疝，危及生命。
