有，其主要副作用为胃肠道反应。服用后出现腹痛，胃肠胀气，水样便等症状。有一些会出现皮疹，荨麻疹，瘙痒等过敏性反应。还有一部分会出现转氨酶升高的症状，食欲减退，尿的颜色加深，粪便颜色变浅，右上腹部有疼痛的，同时伴有黄疸的症状，应尽早做肝功化验检查，同时停止口服药物。
该药物和其它许多减肥产品不一样的，重要特点之一就是达到的减肥效果是排油不是排水，并且持续有效，而均匀减肥。要坚持服用2个疗程才能达到减重的效果，合理饮食加有氧运动配合本品减肥效果极好。
患者减肥吃奥利司他胶囊可以根据个人情况吃护肝片，有利于机体健康保障。
奥利司他胶囊属于抗肥胖症药，可以抑制脂肪在患者胃肠道的吸收，从而减少热量的摄入，达到减肥的目的，但可能会加重肝脏负担，诱发药物肝损伤。因此，患者可以根据个人情况在医生的指导下在吃奥利司他胶囊期间加用护肝片，比如常见的葵花护肝片，其属于具有疏肝理气、健脾消食的功效，而且可以激活肝细胞并促进肝毒素排出，进而可以有效降低肝脏负担，降低药物所致肝损伤几率。
为养护肝脏、健康减肥，患者平时注意保持饮食清淡，多饮水，多吃新鲜蔬果，忌烟酒及高脂类食物。
长期吃这种药物是可以减肥的，因为这种药物有一定的减肥效果，减肥要采用合理饮食和运动相结合的减肥方法，忌肥腻甜油炸及零食，多蔬菜水果，每天运动半小时如快走慢跑打羽毛球游冰等有氧运动。
奥利司他胶囊通过抑制脂肪的吸收达到减肥的作用，效果还是比较不错，在此基础上不会影响人体对于其他任何物质的吸收，奥利司他胶囊是无须作用于中枢神经的减肥药物，对于肥胖症是能够起到控制体重的效果。
目前奥利司他是全球唯一的OTC减肥药，相对来说还是比较安全的，但是其通常会具有胃肠道的副作用，并且本身是甲减，可能还需要常年服药，因此不建议通过奥利司他减肥.建议采用控制饮食和锻炼的方式来减肥，不要依靠药物。