阴茎短小的治疗方法包括生理性阴茎短小，多见于耻骨联合部、会阴部脂肪较多的男性，可通过手术治疗，去除多余的脂肪，使阴茎得以延长至正常长度，病理性阴茎短小，染色体异常、克氏综合征、卡尔曼综合征导致的阴茎短小，应及时就诊，明确病因，对症治疗。
导致早泄的原因很多的，如心理紧张，有性功能障碍，或存在包皮过长，龟头敏感度高等都会引起早泄的，阴茎短小可以做阴茎延长术。并且要戒烟酒及辛辣的食物，合理正常的性生活，可以去医院进行检查，对症治疗，缓解症状。
肥胖导致阴茎短的小该需要合理减肥，还可以通过手术进行治疗。1、既然是因为肥胖症，那就一定要瘦，最重要的是，体重减轻了，阴茎附近的肥肉就会消退，露出的阴茎就会变大。2、如果出现了很严重的问题，或者多次的减肥不成功，需要做的是在做手术的时候，因为切除了大量的包皮，也会让阴茎变得比之前长。建议家长根据小孩的具体情况，选择合适的方式来处理。
一般情况下，男性的阴茎短小，可以在医生的指导下通过药物治疗、手术治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
阴茎短是一种常见的诊断标准，成年男性的阴茎长度小于4cm，勃起时长度小于8cm。遗传因素、肥胖、雄性激素分泌下降、营养不良等都是导致阴茎短小的主要原因。比如加强营养、外源性雄激素（口服十一酸睾丸酮等）、减肥等。阴茎整形延长手术是由于生殖器畸形引起的阴茎短小。
中国成年男性勃起时阴茎的平均长度为13-14厘米。介绍的阴茎很短，性爱通常持续2-15分钟。阴茎可以勃起但没有插入阴道，或者刚刚插入阴道，或者已经插入阴道不到两分钟，就是早泄。可以积极锻炼身体，增强体质。可以口服补肾壮阳的中成药。
阴茎短小，先去医院抽血化验性腺系列。如果正常，最常见病因就是手淫和包皮过长，尽快彻底戒掉手淫，手淫导致发育期发育不良或者停止，阴茎海绵体挫伤，阴茎越来越短小，增加营养，多吃高蛋白食物，牛羊肉，海参，另外包皮过长、肥胖也是阴茎短小病因，如果有包皮过长割掉包皮，肥胖必须减肥，对发育期阴茎发育有好处。