首先判定结石的大小和积水的程度。针对于较小的结石，如直径为0.5cm～0.6cm，可采用口服排石药物及解痉药物，辅以运动，促进结石的排出及积水的减轻。对于相对较大的结石伴轻中度积水，肾脏功能无明显损伤者首选体外震波碎石。对于结石较大且积水较明显者，可给予行经皮肾镜取石术及结石溶石治疗等。而对于肾脏无功能者，尤其合并感染者可行肾切除术。
结石引起肾积水就应该去医院检查看一下。若是结石直径在零点六厘米一下，可以考虑多喝水，多运动，配合着一些药物进行治疗。若是结石太大就要考虑做体外碎石或者是手术治疗了。
一般情况下，当患者查出肾结石或肾积水时，要做CT，才能确定肾结石的确切部位和肾积水的严重性。此外，0.4cm的肾结石属于较小的一种，可以自行排泄，例如多喝水、适当运动等。但也有部分患者由于解剖结构的关系，例如输尿管太窄，无法取出0.4cm的肾结石。这些患者可以用一种叫做体外碎石”的方法把石头打碎，再把肾结石弄出来。如果没有排除，还得做手术治疗，否则肾积水会变得更严重。在日常生活中，患者应该避免食用含有草酸的食物。
应该是输尿管结石引起了肾积水情况。有的时候可以做一个腹部CT以及腹部的B超明确诊断。明确诊断之后，还需要完善尿常规以及凝血功能，还有血常规。输尿管的结石大部分是由于肾结石向下排出的过程中堵塞输尿管引起的。由于输卵管的资金是比较小的，所以比较小的结石就容易引起输尿管的堵塞，输尿管堵塞之后，肾脏产生的尿液不能够及时的向膀胱排出，就容易导致肾积水。
肾结石出现积水时，需要尽快解除尿道梗阻。小的结石可以应用排石药物，如硝苯地平类钙离子拮抗剂，能够舒张输尿管促进排石，多饮水勤排尿避免憋尿，跳跃运动也能够促进排石。
如果结石大于0.5厘米小于1.2厘米，结石嵌顿的时间不长，肾积水不严重，可以考虑体外震波碎石。如果结石在输尿管下段，怀疑有肉芽组织包裹，建议行输尿管镜钬激光碎石。如果结石在输尿管上段，可以考虑输尿管软镜或者经皮肾镜手术。
