抗甲状腺过氧化物酶抗体为自身免疫损伤的标志物，也是诊断甲状腺自身免疫性疾病的首选指标。若其有所增高，则代表着体内存在自身免疫的破坏。若在升高的同时，出现促甲状腺素下降，血清游离T3、T4升高，表示合并甲亢，此时应接受抗甲亢药物治疗。
甲状腺球蛋白抗体过高说明机体产生以甲状腺为抗原的自身抗体，常见于自身免疫性疾病，包括桥本甲状腺炎、弥漫性甲状腺肿伴甲亢。
一些自身免疫性疾病包括多发性肌炎、系统性红斑狼疮、皮肌炎，都属于自身免疫性疾病，都可以出现甲状腺球蛋白抗体过高。当甲状腺球蛋白抗体升高时，应检查原发病。在甲状腺疾病中，桥本甲状腺炎抗体远高于格雷夫斯病，即常见的弥漫性甲状腺肿伴甲亢。甲状腺球蛋白抗体升高引起的桥本甲状腺炎，如果没有甲减，目前不需要特殊治疗。
保持甲状腺功能正常，在饮食上要注意，不要吃辛辣刺激食物，要少吃海产品，少吃海带，紫菜，黄豆，卷心菜一类，忌吃富含胆固醇的食物如动物脑，内脏等，先用高脂肪食物如食油，花生米，芝麻酱，火腿，五花肉等，因为它们会引起甲状腺肿大。
甲状腺球蛋白抗体是自身免疫性甲状腺疾病患者血清中的一种常见自身抗体。
自身免疫性甲状腺疾病是一组非常常见的甲状腺疾病，如桥本甲状腺炎、Graves病等。甲状腺球蛋白是甲状腺球蛋白抗体的靶抗原，是由甲状腺上皮细胞合成、分泌的可溶性碘化糖蛋白。认为抗甲状腺球蛋白抗体对甲状腺无损伤作用。抗甲状腺球蛋白抗体与甲状腺球蛋白结合后，与F受体结合的抗体相互作用，激活NK细胞攻击靶细胞，引起甲状腺细胞破坏，引起各种甲状腺疾病。其共同特点是血中存在多种甲状腺自身抗体，以抗甲状腺球蛋白抗体为主。
抗甲状腺过氧化物酶抗体高影响怀孕的。抗体异常升高，可以诊断为自身免疫性甲状腺疾病，对于这类孕妇人群需要对甲状腺功能，进行更加密切的监测，很容易出现甲减，一旦出现甲功减退，则需要及时补充甲状腺激素替代治疗。
抗过氧化物酶抗体高是因为免疫系统有错误，抗过氧化物酶抗体高的临床诊断为桥本氏甲状腺炎，也就是慢性淋巴细胞性甲状腺炎。
产生抗过氧化物酶抗体意味着身体中会发生自身免疫防御反应，抗体不会损伤甲状腺。因为自身免疫炎症导致的甲状腺增大往往最终缩小。甲状腺不断破坏、损伤，需要合成分泌甲状腺激素不足身体时，甲状腺功能减退。桥本氏甲状腺炎确诊后行甲状腺超声诊断，无高恶性风险结节，无甲状腺功能异常，无需特殊治疗，定期复查，每年仅行甲状腺功能检查一次。如果出现甲状腺功能下降，用左甲状腺激素钠替代治疗维持甲状腺功能正常，不需要特殊的饮食和药物注意。
