先天性缺牙的原因有可能是遗传性的因素所导致和环境因素都有关系的，胚胎期牙板发育受到物理障碍或者牙板断裂。空间受限，产生压力，使牙胚得不到最低限度的营养而退化，特别是第三磨牙。造成上皮组织功能缺陷或其下方的间充质诱导失败。
乳牙掉了半年也不长恒牙，有可能是缺钙了。平时要多给孩子吃一些含钙量比较高的食物。比如牛奶，鸡蛋，豆制品。平时适当多晒太阳，也可以稍微吃一些有一定硬度的食物。
缺牙数目较少时对咀嚼功能、牙列形态和美观影响不大，可以不做处理，多数牙先天缺失不仅影响咀嚼功能，而且影响患者的容貌，给患者生理和心理造成损害。因而缺牙数目较多时，可做活动义齿修复。
通常来说，先天性无牙胚一般指先天性缺牙，而先天性缺牙的宝宝几率不高。
先天性缺牙是指在牙胚形成过程中未能发育和形成的牙，可发生于乳牙，也可发生在恒牙，发生率通常比较低，所以先天性缺牙的宝宝几率不高。而这种情况可能与遗传、胚胎早期受有害物质刺激、咀嚼器官发生退化等原因有关，建议去医院检查，然后在医生的指导下进行对症治疗。
这叫乳牙滞留，孩子一般从6、7岁进入换牙期，首先替换的就是上下的前门牙。由于现在孩子的饮食过于细腻，这样就导致乳牙得不到更大的咀嚼刺激，牙根吸收缓慢，以至于恒牙已经萌出乳牙还没有及时的脱落，这样恒牙就会偏向舌侧萌出。建议及早的带孩子找专业的口腔医生检查，然后及早的拔除滞留的乳牙，这样恒牙才能有位置正常的萌出，不至于长歪。
乳牙龋齿可能会影响恒牙。
因为恒牙在肉芽的根分叉之下，或者在乳牙的根尖下面，都会对恒牙产生一定的影响，比如乳牙有龋齿，就会导致根尖炎。因为根尖炎会对继承的恒牙的牙胚产生影响，从而导致继承恒牙牙胚的幼稚发育不正常，从而导致继承恒牙牙胚的形态异常。
根尖周炎也会导致牙槽骨的损伤，从而影响到正常的恒牙萌出，如果是乳牙龋齿比较严重，就会导致继承恒牙的空间变小，萌出的时候位置不够理想，从而出现错颌畸形。