巧克力囊肿手术后怀孕几率还是很大的。一般巧克力囊肿手术之后，如果要是复查的恢复的比较好，一般是尽早的怀孕，因为怀孕之后月经就不会来了，对巧克力囊肿的治疗恢复有一定的帮助的。所以如果做完手术以后检查恢复的很好。
巧克力囊肿手术后不会影响受孕的。卵巢巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种。引起不孕的原因复杂，如盆腔微环境改变影响精卵结合及运送，免疫功能异常导致抗子宫内膜抗体增加而破坏子宫内膜正常代谢和生理功能。
巧克力囊肿手术后，如果月经恢复正常，卵巢有正常的排卵，这样怀孕的几率是非常高的。巧克力囊肿的面积还非常小，是可以怀孕的，几率比正常人低一些而已，这是因为巧克力囊肿是长在卵巢部位，会直接影响卵巢的排卵功能。
巧克力囊肿需要大约半个月的时间来恢复怀孕前的身体，并且疾病会在怀孕后恢复正常。手术后准备的妊娠越早，妊娠的可能性就越高。经过一段时间后，疾病复发了。此外，这种疾病的复发率很高。随着时间的推移，怀孕的能力会逐渐下降，手术后是最容易的时期。
巧克力囊肿手术后怀孕有可能会对胎儿带来影响，因此需要及时到医院进行检查。
巧克力囊肿手术以后会导致盆腔粘连，影响到输卵管，因此会影响到排卵功能，因此需要及时到医院进行检查，如果影响到胎儿健康，需要遵医嘱及时的终止妊娠，因此在做完手术后应该采取相对应的避孕措施。
在恢复期间可以多补充身体所需要的营养，而且还需要适当的进行锻炼。
巧克力囊肿，属于子宫内膜异位症的一种，通常手术后三个月后再开始备孕。术后要注意不可以随便服用药物，尤其是激素类的药物，可以多吃些高蛋白高营养的食物，增强体质。平时注意少吃生冷辛辣刺激性的食物，注意腹部保暖，避免身体受风着凉，不要过度劳累和熬夜。