有巧克力囊肿并不意味着无法怀孕。巧克力囊肿又称卵巢子宫内膜异位症囊肿，是引起痛经以及不孕不育的常见因素。如果是比较小的巧克力囊肿，临床症状不典型时可以先尝试怀孕，是有几率成功怀孕的。但是如果巧克力囊肿比较大，或者引起明显的痛经症状时，建议应该先进行手术治疗，同时在术后使用药物才能够提高术后的受孕概率。
卵巢囊肿穿刺检查治疗本身对于妊娠是没有什么影响的，但卵巢本身可能会引起出现排卵异常和导致不孕的情况。卵巢囊肿的治疗原则在意一旦发现要及时给予手术治疗。仅仅是比较小的卵巢囊肿对于妊娠是没有什么影响的，穿刺后是不会影响怀孕的，所以在穿刺后是可以生小孩的。
患有巧克力囊肿是影响正常受孕的。
会产生有40%不孕的可能，不过很多患者也是可以正常怀孕的。导致不孕症的原因和囊肿的大小以及粘连的程度有关系，巧克力囊肿是子宫内膜异位症中最常见的一种，多数为一侧卵巢，也有双侧卵巢同时发病。如巧克力囊肿发生破裂，囊内所含的陈旧性经血会向腹腔扩散，严重影响生育功能。囊肿破裂后会引起剧烈腹痛。
巧克力囊肿主要是平时痛经和月经量增多的情况引起的，也是会影响怀孕的，囊肿比较大的，也是需要手术来治疗的。如果打算要孩子可以安排在排卵期同房，可以增加怀孕的几率。
做了巧克力囊肿手术，不影响怀孕的，首先要放松心情，加强营养，多吃一些豆类食物，补充雌激素，就是加强锻炼，增强体质，备孕期间吃叶酸，预防胎儿神经管畸形的，平时多多注意保养会慢慢好转的。
巧克力囊肿也称为子宫内膜异位症，有巧克力囊肿，怀孕的几率是10%左右。要先治疗好巧克力囊肿，可以考虑腹腔镜手术治疗。有巧克力囊肿也有可能有痛经，所以根据情况再进一步检查治疗。