左侧卵巢冠囊肿不一定会影响怀孕，卵巢冠囊肿如果比较大，就要通过手术治疗，手术治疗后只要另一侧卵巢是健康的，那就不会影响到以后怀孕的，采取针对性的治疗手段，待身体完全康复后再备孕。
1.手术治疗，可行囊肿剥出术，不要求生育者可行一侧输卵管切除。尽量保留正常卵巢组织。2.位于卵巢门、宫颈旁的囊肿，分离时要避免损伤血管，如果卵巢门处出血，势必缝扎止血，囊肿剥除后，需仔细止血。
左侧卵巢冠囊肿属于卵巢肿瘤，主要是因为卵巢内有肿块形成，肿瘤有良性和恶性之分，左侧卵巢冠囊肿属于良性肿瘤，但会发生恶变的可能。此病恶化导致病死率极高，位于妇科肿瘤前几名。导致左侧卵巢冠囊肿主要原因有长期不良的饮食和生活习惯有关，以及因体质酸化的原因导致其他组织的癌变。
卵巢冠囊肿主要是女性非生殖器囊肿中的一种，又称为卵巢旁囊肿、输卵管旁囊肿。卵巢冠囊肿有腹部疼痛不适或是腹水，腹腔压迫感等症状，需要去做B超和腹腔镜检查进行确诊的。
卵巢冠囊肿就是卵巢囊肿，卵巢冠囊肿一般是良性的囊肿，也有可能为炎性肿块，输卵管积液等情况。要依据具体临床症状表现，排除其是否为炎性包块的等无需手的情况，一般是抗炎处理后复查其变化情况，若有明显减小或消失，那自然是炎性包块了，抗炎治疗即可。
卵巢巧克力囊肿手术后有可能会复发，因为巧克力囊肿本身就是由于子宫内膜异位在卵巢，并且周期性的出血才形成囊肿，手术后具有活性的子宫内膜细胞很可能随着月经周期再出血，就会导致复发。