如果是精子或者卵子有问题，会造成精子和卵子的结合，从而产生的受精卵质量差，也有可能是孕妇和胎儿血型不合造成的。当然，在怀孕的时候，胎盘的发育也会受到影响，导致胎儿生长缓慢，甚至是导致胎儿死亡。还有就是在怀孕的时候，如果情绪波动很大，很容易导致流产。如果是因为自身的子宫发育不良，或是患有子宫肌瘤等疾病，都会造成自然流产。在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。
胚胎停育的原因主要有四个方面。生殖内心泌方面，因为胚胎早期发育的时候，需要三个重要的激素水平，分别是雌激素，孕激素，绒毛膜促性腺激素，如果母体自身的内源性激素不够，就满足不了胚胎的需要，就会造成胚胎的停育；生殖免疫的问题，如果自身有某种抗体，就会抵制胚胎的发育等。
胚胎停止发育有的是胚胎本身发育不好，自然死亡，有的是激素不足以支持胚胎发育，造成死亡或宫腔畸形使胚胎无法生长。明确诊断，早孕之后出现胎停，说明胎死腹中时候，胎儿不一定会自动流产，多数需要人工干预，也就是做稽留流产手术。
不一定都会自然流产，虽然大部分自然流产可能会伴随着胚胎停育，会完全排除胚胎组织和附属组织，但是不排除一种现象就是不能自已流干净，导致组织稽留在宫内的现象。这个时候，流产不彻底，宫内还有残留，就要及时清宫。
如果胚胎已经排出体外的话，就说明已经出现了自然流产。最常见的原因就是怀孕以后劳累过度，走路太多或者扭伤，还有可能是怀孕以后体内的孕酮数值低等，如果已经出现了自然流产的话，清一下宫。
