生殖器有小肉粒可以通过物理治疗、饮食调理等方式进行治疗，具体分析如下：
生殖器上出现小肉粒，如果最近有过不干净的性生活，可能是因为人乳头瘤状病毒所致的尖锐湿疣，需要到正规的医院泌尿外科进行激光、电灼等手术，将这些肉粒去掉，然后在皮肤上涂上干扰素软膏，可以将体内的病毒完全排出体外，防止以后复发。在治疗过程中，不能同房，不能吃辛辣刺激性食物，不能饮酒、不能进食海鲜。
生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染引起的一种性传播疾病，发病率很高，具有传染性，在初发的时候通常会伴有发热乏力的症状，可以选择抗病毒治疗，避免不洁性生活，是可以控制病情的。
男性生殖器上有黑点可能是因为有包皮龟头炎而导致的，也有可能是因为暴力性生活之后而导致的。
男性生殖器上有黑点可能是因为患者长期不注意个人卫生清洁，导致生殖器官被细菌感染，从而引发的龟头炎。他会使患者生殖器官皮肤粗糙，局部长出黑点，出现淤血等症状。在性生活时，动作幅度过大，导致摩擦损伤，也有可能会导致生殖器官出现小黑点。
这是尖锐湿疣，尖锐湿疣在潜伏期的时候，是没有什么症状表现的，很难发现，无法诊断，还有尖锐湿疣病人在发病之前，因为这时的尖锐湿疣还没有任何症状，就察觉不出来，因此，只有靠大家细心观察，发现蛛丝马迹，尤其感觉身体出现了变化，不要忽视自己身体上的一些细节变化，然后进行适当的检查，就可以提早检查出来。正常人是不会长肉芽的。
生殖器疱疹的发病，一方面是感染了单纯疱疹二型病毒，另一方面是机体或局部免疫力下降。因此治疗也要从这两个方面入手，即抗病毒、提高免疫力。但是疱疹病毒潜伏在体内是不容易去除的，这也是生殖器疱疹易复发的一个原因。
肉芽肿不治可以继续增大，到正规三甲医院外科就诊检查，采取相应的治。不同部位和不同病因的肉芽肿其治疗方法不一样，注意患处卫生，避免挤压摩擦，以免加重症状。身体某部位有组织肉芽肿，是与炎症，摩擦，治不当等多因素有关系，需尽快治，以免加重影响康复的。