碘131具有较强的放射性，会破坏甲状腺组织细胞。碘131还有可能造成患者出现粒细胞减少，咽喉痛，抵抗力下降等症状，要谨慎的选择治疗方式，应该要尽量的减少疾病对于身体的影响。
用碘131治疗甲亢需要注意服131碘两小时后才能进食。用药后应注意休息，避免过度劳累、情绪激动，以免诱发甲亢危象。一个月内禁服含碘药物、禁食各类海鲜食品，以免降低治疗效果。
甲状腺内储存的激素足够维持1-2个月，所以碘131治疗后短期内，甲状腺内储存的激素释放入血，出现甲亢症状的加重，随着储存激素的耗尽，甲亢症状逐渐好转。碘131治疗甲亢见效的时间大概1月。半年后，如甲亢没有治好，可以再次行碘131治疗。
碘治疗后常见的短期（1-15天）副作用包括：乏力、颈部肿胀、咽部不适、口干、味觉改变、鼻泪管堵塞、上腹部不适或恶心，以及泌尿道的损伤等。晚期并发症主要是甲状腺功能减低，131碘治疗后引起的一过性甲低，症状较轻，经6~9个月可自行消失。另一种是永久性甲低，需要终身服用替代药物治疗。
碘131，属于一种放射性核素，治疗甲亢主要就是破坏甲状腺滤泡，使甲状腺一过性释放增加，破坏甲状腺激素合成和分泌的场所，那么约50%的病人治疗后会出现甲减，需要终身口服甲状腺激素替代治疗。
甲亢的病人用该药治疗大约在6个月左右可以恢复正常，但也有复发的可能。甲亢的病人尽量采取口服药物的方法进行治疗。口服药物治疗甲亢的方法，再用该药治疗甲亢时。病人应在专科医院进行治疗，防止引起辐射等不良情况的发生，应严格遵守医生指导治疗。