甲状腺囊肿的治疗方法因情况而异：
1、囊肿较小，无症状者，建议患者观察、随访即可，每年复查超声及甲功观察囊性肿物变化。
2、但出现囊肿大、压迫症状，如气管移位、患者呼吸不畅等症状，可尝试手术治疗。当然，部分医院尝试囊肿穿刺抽吸囊液，这种治疗方式效果不太肯定，且复发率相对较高。
3、如果囊性肿瘤是囊性的，而不是纯囊性的，这将引起一定的重视。此时，应观察囊性肿瘤的实性成分、大小及形态。尤其是有一定恶性超声表现时，需进一步检测，治疗可能需要手术干预。
甲状腺囊肿的治疗方法如下：
1、囊肿体积在2.5厘米以下或2厘米以下，边界清晰，周围无浸润可观察或中医及内科治疗；
2、出现严重桥本病，即慢性淋巴细胞毒性甲状腺炎建议给予内分泌治疗；
3、持续性、多发性甲状腺囊肿患者可给予手术治疗，过程中应避免呼吸系统感染防止甲状腺脓肿发生；
4、囊肿体积大，患者出现呼吸困难或颈动脉缺血等症状建议及时治疗手术；
5、射频治疗是一种新的治疗方式可以作为方案的替代但不建议。
一般情况下，甲状腺囊肿为甲状腺结节内良性病变，若甲状腺囊肿未对周围血管、气管造成压迫，且没有对颈部外观造成影响，则可不予手术，但需要定期复查以观察。
对于已经形成了较大肿块的患者来说，应该选择保守治疗方案，如果甲状腺囊肿影响颈部外观，或出现压迫周围脏器等症状，通常可考虑手术治疗，如在彩超指引下经皮甲状腺囊肿内穿刺、拔出甲状腺囊肿内液体等。
甲状腺囊肿不是必须手术。
甲状腺囊肿并不一定非做手术不可，疾病的处理方案以结节有无多发及结节的大小为标准，结节边界完整与否，是否钙化等来判断。在临床上有一些特殊类型的甲状腺囊性结节应考虑到外科手术切除。甲状腺囊性结节，绝大部分为甲状腺之结节或腺瘤退变所致，囊肿中还含有血液及微混液体，与四周界限明显，纹理坚硬，通常无触痛，核素扫描为冷结节，少数病人为先天甲状腺舌骨囊肿。甲状腺囊性结节治疗需依据结节有无多发及结节尺寸，结节边界完整与否，是否钙化等来判断。
一般来讲，甲状腺囊肿是否选择手术，要看囊肿的性质和囊肿的大小来决定。
如果经过初步检查，确定囊肿是良性的，没有影响到人体的身体健康。可以选择不用手术。如果囊肿直径小于1厘米可以也暂时观察，但需要每3个月到半年做一次彩超，观察变化。
如果囊性逐步增大，就需要手术切除。如果囊性有恶性的可能，患者需要注意的是，则无论囊肿大小，都需要手术治疗。
甲状腺囊肿是甲状腺结节囊性表现，对于甲状腺纯囊性肿瘤，实际上良性恶性可能性非常低。其治疗因情况而异：
1、囊肿较小，无症状者，建议患者观察、随访即可，每年复查超声及甲功观察囊性肿物变化；
2、但出现囊肿大、压迫症状，如气管移位、患者呼吸不畅等症状，可尝试手术治疗。当然，部分医院尝试囊肿穿刺抽吸囊液，这种治疗方式效果不太肯定，且复发率相对较高。这种治疗还在讨论中，效果不太肯定；
3、如果囊性肿瘤是囊性的，而不是纯囊性的，这将引起一定的重视。此时，应观察囊性肿瘤的实性成分、大小及形态。
