生殖器疱疹的早期可能会出现局部疼痛、瘙痒或者是针刺烧灼感，但是往往并不会持续很长时间，皮肤上会随即比较快的出现小水疱，呈簇状存在，出现水疱以后往往会在两天左右出现破溃，在水疱出现以后，会伴有剧烈的疼痛感。
生殖器疱疹的早期症状只是局部出现很小的水泡或者是淡红色的丘疹，然后会发生溃烂的现象。此病症多发生于男性的包皮、龟头、尿道、也可发生于肛门及周围。尽早的去医院进行诊断治疗。早期治疗效果较好，尽量避免拖延，防止大面积感染。
生殖器疱疹复发的症状有水泡，灼热感，皮肤发红疼痛等。复发性生殖器疱疹较原发性全身症状及皮损轻，病程较短。起疹前局部有烧灼感，针刺感或感觉异常。多注意个人为卫生。
生殖器疱疹是一种传染性，比较高的性传播疾病，她的早期症状就是有灼热感之后会起成堆的小水泡，小丘疹等，在生活中要积极的调整自己的生活状态，不要进行不洁的性交，要多喝水，多排尿清淡饮食。
皮损为红斑基础上可见成群的水疱或脓疱或成糜烂及溃疡。女性病人约90%伴有宫颈炎，宫颈可见发红、糜烂、溃疡，有脓性阴道分泌物。有的病人可有腹股沟淋巴结肿大压痛或体温升高。皮肤病变也可出现在口唇、手指、臀部、大腿、手臂，甚至眼部与咽喉。并发脑膜炎或横贯性脊髓炎，一般于发疹后3-12天出现颈项强直等颅内压增高的现象。
生殖器疱疹感染后平均约4～5日后发病，外阴患部先有灼热感，即发生成群丘疹，可为一簇或多簇，继之形成水疱。数日后演变为脓疱，破溃后形成糜烂或浅溃疡，自觉疼痛，最后结痂自愈，病程约2～3周。女性发病于大小阴唇、阴蒂或宫颈处，呈现集簇性分布，先为红色丘疹，可变成小水疮，疱疹半透明，内含黄色液体，抓后极易破溃糜烂，可灼热疼痛，也可能出现继发感染，腹股沟淋巴结肿大，有压痛，但多不化脓。