主要是保持局部清洁、干燥。可每天用等渗生理盐水清洗，疼痛者可口服止痛药，给予精神状态安慰。并发细菌感染者，可外用抗生素药膏。如果是初发生殖器疱疹，疗程为7～10天；复发性生殖器疱疹疗程为5天。频发复发者则需以较低的剂量服用较长疗程。
男性生殖器疱疹能不能治根，目前还在研究过程中。抗病毒治疗不能完全杀灭这种病毒，它会隐藏在骶神经节内，一旦身体的免疫力降低以后，潜伏的病毒会伺机而动，直接侵袭到外生殖器皮肤和黏膜，从而导致生殖器疱疹的再次发作。如果想要降低发病几率，需要提高自身的免疫力。在治疗方面，在正规治疗的同时，也可以用提高免疫力的药物。
男性生殖器疱疹的病人所表现出来的症状比女性生殖器疱疹的病人明显。多数是在感染病菌后两天到十天以内，就会出现难以忍受的不舒服的症状。男性生殖器疱疹的症状多数发生在龟头、尿道口、冠状沟、阴茎、阴囊等部位，先有灼热感，然后产生群丘疹，有些是一簇，有些是多簇，然后慢慢的形成水疱。时候如果不及时地治疗，几天之后就会转变成脓疱，破了后形成糜烂患者溃疡。感觉疼痛，两到三周后结痂。
男性生殖器疱疹病病补充日常营养即可。男性生殖器疱疹主要由单纯疱疹病毒感染引起泌尿生殖器及皮肤黏膜的一种炎性反应，对于反复发作的，可以加用一些中药治疗，可以预防它的反复发作，加速它的病情恢复。没有症状或者临床感染者无需药物治疗。其次，更重要的应该积极预防，避免它的反复发作，避免不洁的性接触史，发作的时候，保持局部的清洁，预防它的继发感染，还有避免引起诱发的一些因素，如过度劳累、饮酒等。
男性生殖器疱疹多吃清淡的蔬菜类，多喝水以保证水分的补充，更要戒烟戒酒以免病情加重。还要注意休息，保证睡眠时间和睡眠质量，防止劳累。天气冷的时候要及时添加衣物，天热要防止患处出汗，但也不能猛吹空调，感冒发烧都不利于病情的恢复。
如果想要预防生殖器疱疹，在平时的时候一定要洁身自好，平时的时候要拒绝不洁的性生活，在性生活的时候好采取避孕措施，这样可以有效地防止一些疾病的发生。如果有这种疾病需要去医院进行治疗检查和治疗。