进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
生殖检查主要有以下几项一、血液检查包括性激素，甲状腺素、优生十项或优生五项、叶酸、同型半胱氨酸、血常规、血型、血糖、出凝血时间、肝功、肾功、乙肝两对半、丙型肝炎抗体、梅毒、人免疫缺陷病毒、抗精子抗体、抗卵巢抗体等；二、感染因素包括支原体、衣原体、淋球菌、分泌物联检等；三、超声检查包括阴囊彩超；四、造影检查包括输卵管造影、输精管造影等；五、其他的一些检查CT、MRI、宫腔镜、腹腔镜等。
外阴部检查查看阴道黏膜表面是否光滑，质地是否正常，有无出血点，阴道分泌物的性状及气味是否正常。白带常规检查是否有妇科疾病，如患有性传播疾病，先彻底治疗，然后再怀孕，否则会引起流产，早产等危险。宫颈检查确定女性是否患有宫颈炎症，宫颈糜烂和赘生物等，子宫及附件检查查看女性是否会患有子宫肌瘤，卵巢肿瘤，子宫内膜异位症，盆腔炎等妇科疾病。
hpv是一种病毒检查，hpv主要寄生于宫颈管，咽喉及口腔，感染后主要引起宫颈癌前病变，尖锐湿疣，阴道及外阴病变，喉乳头状瘤，临床上可以通过局部的分泌物检查来明确。hpv感染是引起宫颈癌的主要病因，常见的是用于女性宫颈癌联合筛查，临床主要通过标本刷于女性宫颈管内同一方向转6到8圈取宫颈管细胞，然后存放于固定液送去化验明确hpv感染情况。
检查血、分泌物、彩超检测生殖器是男性生殖感染的检测方法。
精液化学成分的测定对进一步认识附睾、前列腺和精囊腺的作用具有重要意义。如果是精液量少、无精症、少精症、精液活性下降、附属性腺先天性缺陷、附属性腺先天性缺陷、附属性腺疾病等，可以做精浆生化检测，主要有肉毒碱、酸性磷酸酶等。
