男性阴茎发育情况如果与正常人的差异很大，那么就需要考虑是否是生殖器畸形。这就需要进一步做性染色体方面的检测。明确是否有假两性畸形或是女性男性化、男性女性化的情况，进一步对症处理。必要的时候可以考虑手术治疗。
从小就阴茎短小只能去医院做手术进行治疗，可以做阴茎延长手术，植入假体。正常成年人的阴茎在勃起的状态下，只要超过9公分就属于正常的，如果短于9公分是属于阴茎短小。
阴茎短小的原因有很多，不仅仅有先天性的原因也有后天性的原因，遗传因素是引起阴茎短小的常见原因，也和体格有一定的关系，一般体格健壮，身材高大的男性生殖器也会发育的大一些，另外在男性出现有隐睾症，内分泌失调，雄性激素分泌不足等的时候都可能会引起阴茎短小。
可能有一定的帮助，但是患者年龄增大的空间非常小了，患者也可以平时做提肛运动，多吃一些补肾的食物。医学上只有一个阴茎延长术，但是也是不是真正的阴茎延长术，而是把阴茎外观上看上去延长了。其实长度也是这么长。
阴茎增粗手术需要一个多月才可能肿胀完全消退，才可能恢复，常吃牛肉，羊肉，狗肉，豆制品可能使阴茎和第二性征的发育，手术后注意休息，暂停性生活，不要吃辛辣食物。不宜食肥腻；肥肉、田螺少食。
头小阴茎短小脚小成年以后，已经很难再进行二次发育。患者可以通过适当的纠正不良的生活和饮食习惯，比如说尽量避免疲劳熬夜，戒烟限酒，多吃新鲜的蔬菜水果，牛羊肉，狗肉，海鲜的产品，适当的进行体育锻炼，增强体质，来改善性生活的质量。