男性性功能障碍可能由遗传、健康状况、激素水平、年龄、疾病（包括慢性病、神经精神系统疾患、内分泌疾病、生殖器官病变）等多种原因所引起。药物、长期大量酗酒或吸毒者，也会出现性功能障碍。精神心理因素对性功能的影响比较突出，包括错误的性观念、过去性经历的影响、环境因素、人际关系紧张等。
性功能障碍是神经损伤、内分泌失调等原因引起的。
神经性勃起功能失调，这是因为主宰阴茎勃起的神经受损所引起的，我们把它叫做神经性勃起功能紊乱。比如前列腺癌，或者是直肠癌，做了手术，切除了前列腺，切除了直肠癌，控制阴茎勃起的神经，就在这两个器官的边缘，如果损伤了神经，就不能再勃起了。另外和还可能是男性的雄性荷尔蒙分泌不足，导致睾丸机能下降而导致的勃起功能紊乱。
性功能障碍的病因很多，有的患者受某种信仰观念的影响，会使患者对性生活产生反感，从而造成性功能障碍，还有的患者也会有器质性的疾病，例如糖尿病患者，睾丸发育不良等。
有些患者会有雄性激素和雄性激素的分泌不正常，从而引起性功能的紊乱。还有一部分患者由于精神上的问题，例如第一次发生性生活，精神上的紧张，没有足够的性经历，没有足够的性技能，会造成某些不正确的性欲，最终造成患者的性欲失调。对于这种情况，要想有效的解决，首先要解决的就是这些原因。
个人因素：最常见的是焦虑，例如怕自己的性能力不足以满足对方要求、怕怀孕、怕性行为被人发觉、怕被对方认为yin荡等。双方关系，例如恐惧、厌恶，双方缺乏感情或缺乏交流等。
避免不良生活习惯避免不健康的饮食习惯，减少应酬，避免酗酒，控制饮食，充分认识到戒烟的重要性和必要性，遇到烦恼忧伤，应冷静思考，不应长期背上精神负担，及时放松与调整紧张心态，缓和与消除焦虑不安的情绪。
不正常的性生活习惯如手淫、性生活过度等和不正常的精神状态如恐惧、紧张、疲劳等引起，器质性的性功能障碍、全身性疾病，泌尿系感染，神经性疾病以及内分泌疾病、射精障碍，早泄、遗精、不射精或逆行射精。