可以使用相关药物进行治疗，另外如果有脚气，需要同时治疗，注意鞋袜的卫生，保持脚部干燥。不要混穿鞋子，防止出现传染。一定要采取积极的治疗措施，因为霉菌还会侵犯身体的其他部位或传染给家人。
灰指甲的出现与甲下真菌感染有关，其中红色毛癣菌、石膏样毛癣菌等皮肤癣菌为灰指甲的主要致病菌。因此，患者可以选用能够有效杀灭真菌的抗真菌感染的药物进行治疗。
常见的抗真菌感染药物多为外用搽剂，如亮甲牌复方聚维酮碘搽剂，该药物能够渗透甲下，作用于患处真菌，达到持续杀菌的功效。在用药期间，需按照说明书或医生指导严格使用。建议患者坚持长期规范用药治疗，有助于达到更好的治疗效果。用药期间，注意调整个人生活、卫生习惯，可帮助药效得以发挥。
常用的方法包括用小利刀刮除松脆病甲，或挫薄增厚的病甲，然后涂碘酒或冰醋酸溶液，也可把病甲浸于碘酒或鹅掌风特效药中，坚持治疗几个月后，即可生出新甲。治疗严重的灰指甲，还要内服药物几个月。
绝大多数灰指甲可以治好。常用的方法包括用小利刀刮除松脆病甲，或挫薄增厚的病甲，然后涂碘酒或冰醋酸溶液，也可把病甲浸于碘酒中，坚持治疗几个月后，即可生出新甲。不要吃辛辣刺激性的食物。
灰指甲称作是甲癣，需要检查真菌，如果真菌阳性的情况就考虑是本病。可以口服药物治疗，手的灰指甲需要口服3个月左右，足部的灰指甲口服4-6个月。同时在外用药的选择上，可以选择消炎类药膏。
灰指甲很容易医治。灰指甲医学名甲癣，因为真菌侵犯指甲导致指甲出现发黄，增厚，不规则脱屑，变形，灰指甲早期会出现指甲发白，是否灰指甲需要到医院进一步确诊，化验真菌涂片，因为真菌会导致传染。所以必须注意卫生，切断传染源，用过物品必须严密消毒，因为指甲太厚药物不好吸收，可以采取塑料薄膜封包治疗，配合口服治疗皮肤深处和浅表都有杀灭能力的药物。