如果输尿管结石小于0.6个厘米，这个时候可以选择保守的疗法，比如说多喝水、多运动、配合一些药物的治疗，当这结石它的大小比较大的时候，或者说结石的形态不光滑，要选择另外的方法了，比如说体外碎石，或者微创手术的方法。
输尿管结石可以考虑行冲击波体外碎石术，也可以考虑行输尿管镜腔内碎石术，这种微创手术方式来解除泌尿系结石的症状。患有输尿管结石，可能会引起剧烈的腰腹部疼痛以及恶心、呕吐等消化系统症状。
输尿管结石依据结石大小、部位及有无合并症治疗方式不一，结石＜0.6cm，没有合并症，可通过多喝水、多运动等排石治疗将结石排出，或是服用排石药物。结石较大，合并梗阻、感染，可行微创手术。微创手术损伤较小，出血较少，优于开放式手术。
输尿管结石手术，常见的就是输尿管镜钬激光碎石、输尿管切开取石、腹腔镜切开取石以及经皮肾镜手术碎石取石，这些手术都需要麻醉，手术后都需要留置DJ管在输尿管内支撑，所以这些手术后患者不能有效的排尿，所以必须要留置尿管。
输尿管结石的治疗，要根据结石的大小、部位、数量、形状，一侧或两侧有无尿流梗阻、伴发感染，肾功能受损程度，全身情况有关系，当绞痛发作时，应该使症状缓解，而后再选择治疗方案。
输尿管结石通常都是由肾结石，掉落下来而形成的。输尿管结石的临床症状是腰痛，肉眼血尿，典型的体征是肾区叩击痛。若输尿管结石小于六毫米，可以通过排石药物来进行治疗促进排石。若输尿管结石大于六毫米，小于1.5厘米，可以通过体外冲击波碎石。若是输尿管结石大于1.5厘米，可以选择手术来进行治疗，常用的手术方式是经尿道输尿管镜钬激光碎石术。