是由于HSV-2的感染所致，这是生殖器疱疹的主要病原体，约占病因的90%，传染后引起初发生殖器疱疹，初发生殖器疱疹消退后，残存的病毒经周围神经沿神经轴转移至骶神经节而长期潜伏下来。
生殖器疱疹好了复发，迅速的变成小水疱，2到3天后破溃形成溃疡，并且剧烈疼痛，随后可结痂，自愈不留疤痕。整个过程可有发热、全身不适和头痛，也有会出现腰骶部神经的异常感觉，病程平均2到3周，但易复发。
生殖器疱疹复发的症状有水泡，灼热感，皮肤发红疼痛等。复发性生殖器疱疹较原发性全身症状及皮损轻，病程较短。起疹前局部有烧灼感，针刺感或感觉异常。多注意个人为卫生。
生殖器疱疹的并发症，主要会引起播散性疱疹，疱疹性脑膜炎，前列腺炎，直肠炎，等一系列疾病的并发症。还会导致一些腰部神经炎，脊柱炎。生殖器疱疹的危害最大的，是可能会引起，尿路系统的疾病，会导致男性不孕症。所以平时要加强锻炼，不要有不洁的性行为，提高自身免疫能力，来抵抗病毒感染。
目前主要是一个反复发作的生殖器疱疹问题，这是一个性传播的疾病，主要的感染病原体是疱疹病毒。患者需要注意休息，增强机体的抵抗力，同时需要积极的使用抗病毒的药物比如说阿昔洛韦治疗，这是一个长期的过程，需要定期复查。
生殖器疱疹是在生殖器部位起的疱疹，所以，生殖器疱疹的症状一般是在生殖器的部位，一般在皮肤和黏膜的交界处出现的红斑，这些红斑经过一段时间就会变成水泡，由于这个水泡的泡壁比较薄，水泡泡壁会破裂，会形成浅的糜烂，有些人可以形成溃疡。