含氟、含抗生素、含硼砂、氯已定的漱口水都最好不好长期使用。长期使用能引起味觉改变。但是别的漱口水是对口腔内的粘膜进行消毒，所以对牙齿基本上是不会有害处或是副作用的。
一般情况下，龋齿痛可以用氯己定漱口水。但是用漱口水并不能治疗牙疼，漱口水只能辅助保持口腔卫生。龋齿痛的原因可能有很多，包括龋齿、牙髓炎、根尖周炎等。
建议患者及时到医院完善相关检查，明确病因后进行对症治疗，改善不适。同时建议患者在平时要保持口腔部位的清洁卫生，饭后漱口。平时也要少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
牙周炎可以使用一些有利于消炎杀菌的漱口水进行漱口，用盐水漱口的效果也是非常好的。用盐水漱口可以稀释、冲洗和清除牙齿表面的食物残渣、软垢和牙菌斑，保持口腔清洁，避免牙结石的形成，降低龋病、牙龈炎和牙周炎的发生率。
拔完牙以后不可以马上使用漱口水，需要拔完牙24小时以后才可以进行漱口、刷牙，因为漱口的动作太大会在口腔内形成快速的冲击，形成很大的压强，这样会导致拔牙创内的血凝块脱落。
患有牙周炎之后经常使用漱口水确实有一定的作用，但是平常应做好口腔的清洁，而且应该把口腔里面的食物残渣全部都给清理干净，必要时可使用牙线清除，这样可防止牙菌斑的出现。因为多数的患者在出现牙周炎之后，考虑是由于牙菌斑引起的，而且在治疗牙周炎时，应及时到医院牙科诊所去除牙齿上的牙结石，然后再解决牙周炎的问题。
