泌尿系结石的病因主要有原因不明机制不清的尿结石称为原发性尿石，代谢性尿石，由于代谢紊乱导致磷酸盐大量增加形成结石。继发性或感染性结石。其实许多因素影响泌尿系结石的形成，尿中形成结石晶体的盐类呈超饱和状态，尿中抑制晶体形成物质不足和核基质的存在是形成结石的主要因素。
是由于尿液中溶解着人体代谢所产生的代谢产物，即尿液是一种溶液，如果存在溶液浓度过高、泌尿道上皮欠光滑、尿流不通畅、泌尿道中有异物等因素存在，浓度过高的溶液中的溶质就会形成结晶而析出，时间长了会慢慢长大，并且有钙盐沉着，从而形成结石。
输尿管是尿液流动的通道，肾脏产生的尿液经过肾盂汇集后，通过输尿管向下运输到膀胱，进而借助尿道排出体外。当输尿管内出现结石时，尿液运输流动会受到影响，肾脏产生的尿液在结石近侧聚集，引起肾脏积水、扩张。严重者可压迫肾脏实质，使肾实质厚度变薄、肾单位功能受损，最终影响到患侧肾功能。可通过手术治疗。
尿分叉原因很多，在男同志比如包皮过长、包茎，最容易导致尿分叉。另外前列腺炎是导致尿分叉最常见的原因，另外尿分叉可以由感染导致，比如尿路感染的时候，尿道口有分泌物，就可以导致排尿时尿分叉。
尿路结石根据结石位置不同症状也不同，肾结石没有腰腹部疼痛症状，会有尿频、尿急、尿痛等泌尿系感染症状，镜下偶尔可以发现血尿。如果引起感染可以出现发热。输尿管结石都会引起肾绞痛，恶心、呕吐。同时发热、尿频、尿急、尿痛症状严重。会有镜下血尿。膀胱结石会出现尿流中断典型症状。泌尿系感染症状较重。多数出现排尿困难。