大多数肝囊肿都是先天性的，对人体没有特别大的危害，基本不需要治疗，如果体积特别大，可能会进行一定的治疗。它对人体的危害也不是特别的大，它和肝癌和其他的肝脏的疾病没有太多的关系。
一般来说，肝囊肿并不需要口服药物进行治疗。
除肝囊肿出现感染需要静脉用药的特殊情况外，通常情况下，针对较小的肝囊肿，仅保持定期彩超随访观察即可；而针对较大的肝囊肿，通常采取腹腔镜下肝囊肿开窗引流术或者局限性的肝段切除术等手术治疗。
肝囊肿患者平时应该适当运动，比如慢跑、游泳等，早睡早起，注意多休息，适量吃新鲜的水果和蔬菜，并清淡饮食，有利于身体健康。
如果是肝脏的囊肿比较小，不需要特别的治疗，可以定时进行检查。但若囊肿大且有挤压感，应立即进行囊肿开窗手术。如有炎症、囊液中有胆汁，应在开窗手术后进行导管引流。若有多囊肝脏的征象，应尽早进行肝脏移植。在日常生活中要注意保持情绪的放松，不要过于紧张和焦躁。另外还要注意多做一些运动，比如慢跑、游泳等，有助于改善症状。
肝囊肿的检查首选b超，可以看到囊肿的大小，数量。不用处理平时生活饮食要注意，不饮酒吸烟。规律生活，不熬夜不过度劳累饮食上以清淡食物为主，不暴饮暴食，多吃新鲜水果蔬菜，补充维生素C。
肝囊肿通常很少引起疼痛。疼痛不适仅在伴随细菌感染和炎症刺激时出现。它主要引起压迫性疼痛，如体积增大和血液循环不良，导致胸闷和胸痛。肝囊肿可以通过疏通或外科穿刺引流来治疗。