治疗可以用冷冻治疗，可以用二氧化碳激光治疗，但是根本上还是要进行抗梅治疗，也就是说可以用治疗梅毒的方法。因为它是一种发生在皮肤黏膜的特殊类型的二期梅毒疹，所以一定要积极抗梅治疗。
扁平湿疣需要采取抗病毒的药物来进行治疗，扁平湿疣是人乳头瘤病毒引起的性传播疾病，扁平湿疣会造成湿热潮湿部位的疣显示为丝状或乳头瘤状，容易融合成不小的团块出现发痒的情况。
大多数得有扁平湿疣的病人是通过静脉注射大量的抗生素，或者口服大量的抗生素来治疗，对于个别比较严重的病人，还可以结合激光治疗。或者吃一些中药进行辅助治疗。可以对病人起到很好的效果。
扁平湿疣样变要考虑是梅毒感染引起的。一般是在外阴和肛周等部位，如果在宫颈处发现了扁平湿疣。宫颈6度是指的宫颈下唇中间的位置，类似于看钟表针盘的六点钟部位。宫颈湿疣位置比较特殊，复发率较高。建议选择纯中药内服外泡治疗，可以彻底消灭皮肤基底层病毒达到标本兼治。
扁平湿疣是一种二期梅毒的皮肤黏膜损害表现。扁平湿疣最先发生的位置，是在肛周以及外生殖器等部位。在早期的时候，它主要在这些位置会出现接近于肤色，或者是肉粉色的扁平丘疹。