子宫内膜异位的中医辨证治疗多以活血化瘀或补养气血的原则，中医认为肝藏血，肾藏精，所以在用药上多选择补益肝肾，滋养气血，加上活血化瘀的药材。还可以选择口服药物，加上中药、针灸。
子宫内膜异位症可以治愈，子宫内膜异位症是一种荷尔蒙依赖的病症，主要表现为盆腔疼痛、不孕、月经不调、下腹疼痛等症状。多数情况属于一种良性的病症，可以通过手术治愈。但是也会出现侵袭、远处转移到其他器官的现象。卵巢子宫内膜异位囊肿是目前最普遍的情况，即使通过外科手术，也有30%的机会会出现反复发作，但要彻底根除是非常困难的。
子宫内膜异位症的治疗要根据患者的年龄、病情的严重程度、是否有生育需求来决定，具体的治疗方法有：
1、保守治疗：可以采用假孕术或假绝经治疗，在子宫中用药来控制女性的经期，从而达到假孕或者绝经的目的。
2、外科：现在采用的是微创技术，即腹腔镜，对病变进行全面的综合、根治性和半根治性的治疗，提高患者生存期、生活质量、怀孕率。
通常情况下，患者可以通过使用药物、手术治疗等方式进行治疗子宫内膜异位症。具体情况分析如下：
使用药物：子宫内膜异位症患者可以口服避孕药、促性腺激素释放激素激动剂（GnRH-a）、雄激素类药物（丹那唑）、孕激素受体拮抗剂（米非司酮）等。
手术治疗：年轻且有生育要求的患者，应进行保留生育功能手术；已有子女且患者年龄较大，应进行保留卵巢功能手术。
子宫内膜异位症西医治疗方法有手术和药物两种：药物治疗，主要是口服激素，即假孕和假绝经疗法。手术治疗。用中医的辨证施治方法，使异位的包块要逐渐的液化。缩小、吸收，异位包块的缩小而减轻，或者全部消失。
子宫内膜异位保守治疗：子宫内膜异位是可以通过药物来治疗的，药物可以使子宫内膜异位的病灶缩小，让症状减轻。通过药物治疗子宫内膜异位，目的是抑制卵巢功能，以诱发异位子宫内膜萎缩。