一般来讲，临床上优先治疗脚气，再进行灰指甲的治疗。脚气和灰指甲都是真菌感染导致的一种传染性疾病，建议可以先治疗脚气再进行灰指甲的治疗。脚气可通过外用药物治疗，例如盐酸特比萘芬乳膏、硝酸咪康唑乳膏等。在脚气治愈后，再对灰指甲进行治疗。常见药物包括亮甲牌复方聚维酮碘搽剂，将该药物涂抹于病甲，其药效成分可渗透甲板，深入甲床，起到持续杀菌作用。其中聚维酮碘、阿司匹林等抗菌消炎成分作用于真菌，能够有效杀死致病真菌，抑制真菌繁殖。症状严重时，可遵医嘱将亮甲联合斯皮仁诺特比萘芬胶囊、丁克盐酸特比萘芬片等抗真菌口服药物治疗。
脚气和甲癣是真菌性传染病，虽然它们不是严重的疾病。然而，要完全治好它并不容易。由于其致病菌是真菌，抗真菌的药物可以在短时间内外用和服用。应特别注意卫生，保持脚部皮肤干燥，穿合适的透气鞋，煮沸后将袜子暴露在阳光下。
脚气和灰指甲都是由真菌感染引起的皮肤疾病，治疗上以抗真菌治疗，脚气以外用抗真菌的药膏治疗为主。灰指甲可以外用药物，但以口服抗真菌药物治疗为主，需要注意的是口服抗真菌药物对肝功具有一定的影响，需要每个月监测肝功。
一般情况下，脚气和灰指甲可以算是一种真菌，具体内容如下：
脚癣和灰指甲都是一种常见的真菌，主要表现为皮肤癣菌。尤其是由于患有灰指甲后会扩散至足部，或是由于患有严重的脚癣所致的灰指甲。不过，脚气和也可能是其他的真菌导致的，比如的毛霉菌、念球菌、絮状表皮藓菌、念球菌等。建议患者平时多加注意保持脚步清洁，谨遵医嘱用药治疗。
灰指甲不是什么不治之症，现在治疗灰指甲有外科手术拔甲(痛苦)，内服抗真菌药物(危害大，损害身体)，局部外用抗真菌药物治疗。这种治疗方法简便易行，不包扎、不耽误正常生活工作。只要每天涂一涂就可以治好灰指甲了。
脚气是由于真菌感染所引起的，如果不积极治疗，有可能引起灰指甲的，建议尽快采取药物治疗，要多注意脚的干净和卫生，勤换鞋，勤洗脚。不要跟别人混穿鞋子，或者共用洗脚盆等。