小脑下垂以手术治疗为主，手术目的是解除后颅窝脑部和脊髓压迫，恢复正常的脑脊液循环。手术方式包括：后颅窝减压术、先前路减压，再颅窝减压及枕颈植骨融合术、后颅窝减压及脊髓空洞切开引流术、后颅窝减压及小脑扁桃体切除术、后颅窝减压、脊髓空洞切开引流及小脑扁桃体切除术。
小脑扁桃体下疝合并脊髓空洞症，相对来说是比较常见的一种复杂颅底畸形，多见于脊柱神经外科。主要是通过手术医治。手术方式包括后颅窝减压手术、硬脑膜扩大减张缝合手术，必要的时候还要做脑积水以及脊髓空洞症的内引流手术。
小脑下疝气，是治疗扁桃体下疝的一种方法。小脑扁桃体狭窄是一种先天性的病症，当胎儿发育的时候，由于小脑的扁桃体进入到了针孔大孔中，会导致一系列的症状，例如：水肿、头痛、眩晕、恶心、呕吐。
治疗上可以通过后颅窝手术，消除小脑扁桃体，颈椎对脑干和延髓的压力，减轻患者的临床症状。手术的结果，和技术的优劣，有很大的关系。
一般来说，小脑扁桃体下疝脊髓空洞症手术过程较为，具体如下：
通常情况下，小脑扁桃体下疝脊髓空洞症手术是全麻手术，患者一般需左侧卧位，用磨钻咬除右侧后颅窝骨质，咬开枕大孔后缘及寰枢椎后弓，进行引流，最后进行缝合。
在手术后，患者应注意卧床休息，避免剧烈运动，保持愉悦的心情，以清淡、易消化的饮食为主，注意营养均衡。
小脑扁桃体下疝伴脊髓空洞症就是枕骨大孔畸形诱发了小脑扁桃体下疝，然后又诱发了脊髓空洞症。最常见的就是枕骨大孔的畸形。枕骨大孔是颅内的一个正常的结构，一般是以圆形和椭圆形为主，有一定的规格。
一般情况下，小脑扁桃体下疝伴脊髓空洞症需要进行手术治疗，具体分析如下：
小脑扁桃体下疝畸形伴脊髓空洞症患者如果出现枕颈部疼痛、眩晕、行走不稳、肌无力等情况，建议进行外科手术。小脑扁桃体下疝气对脊髓中心管的挤压导致了脊柱的缺损，所以外科治疗仅需要切除小脑扁桃体下的疝气。手术要求去除枕骨、后弓软骨和枕骨，以减轻颅内压力，并切开硬脑膜，松解周围的蜘蛛膜，打开第4脑室中央孔，彻底消除对脊髓的压力。
