对于甲亢的突眼，要根据突眼的类型和程度进行相应的处理。
甲亢突眼可分为单纯性突眼和浸润性突眼，单纯性突眼是由甲亢引起的交感神经兴奋升高引起的，以眼球轻度突出、眼裂增宽等为特征。侵袭性突眼会出现异物感、胀痛、畏光、流泪、复视、视力下降等，严重时会出现眼球固定、眼睑闭合不全、角膜外露等现象。
对于甲亢突眼最基础的治疗是控制甲亢。大多数病人在甲亢症状缓解后，突眼的症状会自行消失。
失眠是甲亢的一种常见症状。治疗上要树立甲亢能治好的信心，缓解病人的焦虑。并可以服用镇静药，或者吃神经阻滞剂，来减少交感神经的兴奋性。同时积极治疗甲亢，如果吃抗甲状腺药物治疗，甲状腺功能恢复正常，失眠也会随之缓解。
甲亢引起闭经可以吃中药调理月经，中西医结合一起治疗。恢复生育能力，消除多毛。一旦建立了正常的月经周期，就能受孕，一种是药物治疗，另一种是手术治疗，根据自己情况选择合适的疗法的。
甲亢突眼的治疗首先应控制原发病，控制甲状腺功能的亢进，可相应地使用抗甲状腺药物进行治疗。或专门针对突眼可在眼睛局部应用激素冲击疗法。也可以采用免疫抑制治疗方法，诱发球后组织或肌肉的过度反应。再者就是采用局部放疗的治疗方法。
一般来讲，甲状腺功能亢进症引起的心房颤动。大多数病人在甲亢控制后会转变成窦性心律。如果房颤的历史比较长，并且在控制了甲亢之后很难恢复窦性心律，可以选择药物复律或者电复律。如果复律困难，持续的心房颤动，需要长期使用β受体阻滞剂来控制心室率，同时需要长期使用抗凝药物来预防心源性脑梗塞，比如华法林、利伐沙班、达比加群酯等。
甲亢会引起糖尿病的。
甲亢中的甲状腺激素会加速人体小肠对葡萄糖和半乳糖的吸收，使脂肪组织和肌肉组织更快地获得葡萄糖，并在一定程度上抑制胰岛素分泌，导致胰高血糖素的释放。因此，甲亢患者也会出现糖耐量异常，常表现为餐后高血糖、尿糖阳性，但空腹血糖正常，仍需特别注意。对于甲亢患者来说，如果经过治疗后，病情仍然没有好转，人仍然存在体重下降、乏力、食欲亢进等问题，那么最好及时检查血糖或糖耐量，看是否患有糖尿病或血糖或糖耐量异常，以便更好地治疗。甲亢会引起糖尿病，这是毋庸置疑的。每个患者都要注意自己的病情，尽早检查治疗。