初期肛周脓肿治疗去做肛门指诊检查，肛镜检查等。查找病因对症治疗。生活中注意调养，按时作息，少熬夜，多喝水，多吃新鲜的水果和蔬菜，忌食辛辣等刺激性食物，保持大便通畅。
是由于肛腺感染引起的肛周化脓性疾病，主要表现为肛周肿痛，下坠等不适。治疗方法可以一次性治好或先行脓肿切开手术，可以中医保守治疗。调理排便，养成良好的卫生习惯等对预防肛周脓肿有很好的效果。
肛周脓肿的治疗方法，包括非手术治疗和手术治疗。非手术治疗方法包括应用抗生素治疗，也可以采取温水坐浴和局部理疗，以减轻排便时的疼痛。脓肿切开引流是治疗肛周脓肿的主要方法，一旦诊断明确，即应切开引流。肛门周围脓肿切开引流术，在局麻下就可以进行，在波动明显处做与肛门呈放射状切口，不需填塞，以保证引流。
可在切开脓肿后，用探针仔细检查内口，然后切开瘘管，适当切除皮肤和皮下组织，内口周围组织也稍加切除，使引流通畅。如内口较深，瘘管通过肛管括约肌，可采用挂线疗法。以上手术优点是脓肿一期治好，不再形成肛瘘。但在急性炎症中，找内口有困难时，不应盲目寻找，以免炎症蔓延或形成假道，仅做切开排脓，待形成肛瘘后，再做肛瘘手术。二期手术优点是效果准确，治好的可能性高。
肛周脓肿应该使用抗生素，一般都是应用，革兰氏阴性杆菌的抗生素，温水坐浴，理疗烤电。手术切脓肿切开引流是治疗的最主要的办法，诊断明确就应该切开。肛周脓肿又叫直肠肛管周围脓肿是指，直肠肛管周围的软组织或间隙发生的化脓性炎症。脓肿是急性期的表现，肛瘘是慢性期的表现。
肛周脓肿的病情，那看现在症状不是很严重，那也可先不用手术也行的这时可外用上抗炎的药膏结合上口服的抗炎药物治疗上一段时间看看效果也行，如果说药物保守治疗效果不好，脓肿有增大并且出现疼痛的症状较严重时，这时在考虑手术治疗也行的。