亚急性甲状腺炎治疗方法应结合患者的具体情况而定，并且患者病情存在个体化的状况，并非所有病人所呈现之症状均一致。
要选择合适的药物来进行辅助治疗，这样才能更好地提高疗效，减少不良反应的发生几率。许多病人就是反应不一样，例如，有些病人颈部疼痛非常明显，部分病人颈部疼痛较轻，但当颈部疼痛显著时或较轻颈部疼痛时均需优先选用非甾体抗炎药进行止疼、消炎治疗，只有当非甾体类抗炎药不能控制病人颈部疼痛的情况时，才能考虑适当增加激素治疗。
急性甲状腺炎可以通过药物、手术等方式进行治疗。
急性甲状腺炎的治疗原则是：抗感染和手术介入，在早期确诊后，首先要选择广谱抗生素进行经验治疗，等穿刺物病原体的培养有了效果，再进行抗生素的调整。一般来说，如果合并有一些基本的疾病或者先天性畸形，很难控制感染，需要在2-3个星期内使用抗生素，在脓肿形成后进行抗感染治疗，同时还要进行排脓。
一般情况下，亚急性甲状腺炎可以通过日常护理、使用药物等方式进行治疗，具体内容如下：
亚急性甲亢是一种自限性的病症，哈尊和平时注意保暖，避免感冒。少数病人出现了明显的临床表现、炎症面积比较大，如果出现了明显的症状，可以通过一些药物来进行治疗，以防止出现长期炎症。可以口服阿司匹林、布洛芬、吲哚美辛等非甾体抗炎药物。如果疼痛剧烈、高热不能减轻，或炎症范围扩大，可以服用糖皮质激素，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，以免对身体造成不良影响。
亚急性甲状腺炎是一种由病毒感染引起的局部甲状腺炎，大多数发病前都会出现上呼吸道感染的症状，主要表现为发热、颈痛、心悸、乏力、消瘦、纳差、恶性等症状，可以通过口服糖皮质激素或非甾体抗炎药来治疗。
如果是单纯性亚急性甲状腺炎，通常不会被认为是细菌感染，平时不需要使用抗生素，亚急性甲状腺炎合并气管、支气管感染、化脓性扁桃体炎、肺部感染等都可以使用抗生素进行抗感染。
亚急性甲状腺炎的治疗方法主要是对症治疗。
急性甲状腺炎是一种自身局限性疾病，主要表现为发热、甲状腺痛，经过一定的病程病情逐渐自行缓解。患者需要充分休息，如甲状腺痛明显可给予非甾体抗炎药止痛。如果发热体温在38以上，可以给予退烧药。发热、甲状腺痛症状严重，患者无法耐受，可接受糖皮质激素治疗。使用糖皮质激素可以迅速缓解症状，减轻亚甲蓝症状。但糖皮质激素有一定的不良反应，激素在早期停药后病情反复，必须谨慎使用糖皮质激素。
急性甲亢是急性化脓性甲状腺炎，而化脓性甲状腺炎则是因为细菌感染引起的，因此，对于急性化脓性甲状腺炎，可以通过抗感染来进行抗感染的治疗，口服抗生素。
因此，如果出现了急性化脓性甲状腺炎，可以口服一些抗生素来进行快速的治疗。当然，对于急性化脓性甲状腺炎，可以通过口服抗生素来进行抗菌治疗。如果不采取保守疗法，还可以通过外科切开引流来进行治疗。