有助病人度过大便关，尽可能减少病人的痛苦。应鼓舞病人多吃蔬菜水果、多饮水，使他们心情轻松，养成定时大便的习惯。应该多食平淡并含有丰富维生素的食品，如蔬菜有冬瓜、丝瓜、绿豆、萝卜等。经久不愈的肛瘘多属虚型，饮食上应食含有丰富蛋白质类等食品，如瘦肉、牛肉、蘑菇、大枣、芝麻。
一旦确诊为肛瘘，唯一有效的方法就是手术的，除此之外没有任何保守疗法的，可以选择微创无痛手术的。建议多注意观察目前的情况，可以使用碘伏液进行擦拭消毒。疼痛感会随着时间慢慢减少减小。恢复需要一个多月的时间。
大多的时候这样的病人，可以多吃一些易消化的食物为主，比如清蒸的鱼类，不能含有鱼刺，比如蒸水蛋。在食物中可以增质量，增加一些既柔软又有营养的食物，饮食方面一定不要吃过于油腻、过于难以消化以及蛋白过高的食物。
肛瘘可以选择手术进行治疗。有时可以暂时关闭瘘口而不排出脓肿，导致局部肿胀和疼痛，体温升高，随后封闭。闭合性瘘破裂，脓液排出。瘘管也可排出气体或粪便。同时要保持大便顺畅，不吃辛辣刺激性食物。
如果确诊是肛瘘，应该及早进行肛瘘切除术，消除内口，如有分支管道，清除分之瘘道，定期换药。保守治疗效果一般容易复发。禁食辛辣刺激性食物，保持大便通畅及肛周清洁，便后可用花椒水清洗肛周，避免久蹲。
肛瘘病人应多食清淡并含有丰富维生素的食物，多吃蔬菜水果，如苹果、香蕉、梨等、冬瓜、丝瓜、绿豆、萝卜等加强肠蠕动而通利大便。宜食蜂蜜，每日清晨空腹服蜂蜜一杯，其有清热补中，润燥滑肠。
