治疗灰指甲通常需选用抗真菌药物来进行。因指（趾）甲生长较慢，角质层比较厚，治疗时间会比较长，因此治疗时一定要保持耐心，足疗程规范用药。
若患者指（趾）甲出现不规则变形的表现，一般需在用药前将变形的指（趾）甲修挫掉，再外用抗真菌药物，如亮甲复方聚维酮碘搽剂。亮甲是治疗灰指甲的专用药，所含聚维酮碘、阿司匹林等成分可起到杀灭甲下真菌、抑制真菌再生、消炎止痒、加快药物渗透的作用，患者可按疗程并足量用药，能较显著地改善指甲变形、变色、翘起、糟碎、脱落等症状。不过需注意，如患者有多个指（趾）甲都已出现病变，则可在外用药物的同时，遵医嘱与口服抗真菌药物搭配治疗，如特比萘芬、伊曲康唑等。
由于灰指甲治疗周期较长，故用药方面需注意规范，不建议患者采用民间偏方或土方治疗，可能会加重病情或延长治疗时间，对患者的健康造成损害。
灰指甲即甲癣，也叫甲真菌病，是由皮肤癣菌、酵母菌等真菌引起的指（趾）甲感染疾病，该病的治疗通常可通过抗真菌药物来进行。
灰指甲患者可使用含有抗真菌药效成分的外用或口服药治疗，常见为聚维酮碘、特比萘芬、氟康唑、伊曲康唑等。轻症患者可直接通过外用药物来改善病症，如以聚维酮碘为主要成分的亮甲复方聚维酮碘搽剂，该药不仅含有杀菌抑菌的聚维酮碘，同时还含有阿司匹林成分，能够在患处分解为水杨酸，起到消炎止痒、加快药物有效成分渗透的作用。若患者症状比较严重，也可与口服抗真菌药物进行联合治疗，可发挥较显著的疗效。
需注意的是，患者需基于自身病情，结合医生指导规范用药，不可盲目使用，以免加重病情。
继续采用药物坚持治疗。直到局部的症状消失后，再巩固治疗1~2周的时间能够治好。另外平时也可以使用花椒水泡脚，也能够有效的预防和治疗真菌感染，穿的鞋子也应该疏松透气，这样有利于脚的健康。
怎么判断是不是灰指甲，是依据指甲的表面的改变，一般灰指甲出现以后，指甲可能会出现一定的色泽的改变，通常主要表现为不是太光滑，而且表面混浊，同时在游离缘可能会出现增厚，或者有粉末状的表现、外观。当然只是外观上的表现，因为从外观上判断也不能100%的确定是灰指甲，如果百分之百的确定，必须要进行显微镜检查。
一般情况下，削掉很厚的灰指甲可以使用小刀或指甲锉来处理。具体内容如下：
灰指甲是一种常见的甲壳和甲下组织受到损伤的疾病，主要是真菌感染。灰指甲有可能是因为真菌感染引起的，比如皮屑明显增生，这是灰指甲的甲板增厚。临床上建议去三甲医院的皮肤科，让医生尽可能的修剪自己的指甲。一般都是用小刀或者是指甲锉来去除。但是在脱掉了病甲之后，要立即进行抗菌治疗。因为如果没有及时的抗菌处理，指甲会再次长出，并且会越来越厚。另外，剪掉指甲后，还能起到一定的抗菌作用。